RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 CenppQ9CZ92 286 aa27.2■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa27.2■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa27.2■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa27.2■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cct4P80315 539 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Klc3Q91W40 508 aa27.19■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa27.18■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cwc25Q9DBF7 416 aa27.18■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arap2Q8BZ05 1703 aa27.18■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gnat3Q3V3I2 354 aa27.18■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Bcar3Q9QZK2 820 aa27.17■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nek4Q9Z1J2 792 aa27.17■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nkx1-2P42580 305 aa27.16■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zbtb1Q91VL9 713 aa27.16■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Stard3nlQ9DCI3 235 aa27.16■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ppm1gQ61074 542 aa27.16■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa27.16■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 GakQ99KY4 1305 aa27.15■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa27.15■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zkscan2G3X952 960 aa27.15■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Myd88P22366 296 aa27.15■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ssc5dQ8BV57 1371 aa27.15■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Bsdc1Q80Y55 427 aa27.14■■□□□ 1.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 GpkowQ56A08 488 aa27.14■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa27.13■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Casz1Q9CWL2 1761 aa27.12■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zbtb3Q91X45 518 aa27.12■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa27.12■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa27.12■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tmem87bQ8BKU8 555 aa27.11■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Adora1Q60612 326 aa27.1■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fam213aQ9CYH2 218 aa27.1■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Taok3Q8BYC6 898 aa27.08■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 AtrnQ9WU60 1428 aa27.08■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Prr29B1ARI9 187 aa27.08■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rabep1O35551 862 aa27.08■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
Opn3-201ENSMUST00000027809 ChgaP26339 463 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa27.07■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa27.07■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hmox1P14901 289 aa27.06■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cypt2Q6P924 180 aa27.06■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 RestQ8VIG1 1082 aa27.06■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ppp6r3Q922D4 844 aa27.06■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Prr5lA2AVJ5 370 aa27.06■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 CanxP35564 591 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dnai1Q8C0M8 701 aa27.05■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 NexnQ7TPW1 607 aa27.04■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Miga2Q8BK03 593 aa27.04■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kif2cQ922S8 721 aa27.04■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Lama4P97927 1816 aa27.03■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Smc4Q8CG47 1286 aa27.03■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Q9D2X8 372 aa27.03■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Adam1aQ60813 791 aa27.02■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Prl3d2F6R3P9 224 aa27.02■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Clca2Q8BG22 942 aa27.02■■□□□ 1.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ppfibp2O35711 882 aa27.01■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ets1P27577 440 aa27.01■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa27■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Greb1lB9EJV3 1913 aa27■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa27■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cyp19a1P28649 503 aa27■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa26.99■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Lrit1Q8K099 624 aa26.99■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Esco1Q69Z69 843 aa26.98■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sptbn5F6UCX4 1208 aa26.98■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fam228bQ497Q6 232 aa26.98■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Q8C5K5 320 aa26.98■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 C4bP01029 1738 aa26.97■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arhgap33Q80YF9 1305 aa26.97■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Bicdl1A0JNT9 577 aa26.97■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa26.97■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ttc19Q8CC21 365 aa26.97■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slfnl1Q8BHW9 410 aa26.96■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm10093D3YYI8 482 aa26.96■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Unc5clQ6R653 518 aa26.96■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rnf123Q5XPI3 1314 aa26.95■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa26.95■■□□□ 1.91
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sult6b1P0CC03 303 aa26.95■■□□□ 1.9
Opn3-201ENSMUST00000027809 Smarcc1P97496 1104 aa26.95■■□□□ 1.9
Opn3-201ENSMUST00000027809 Erc2Q6PH08 957 aa26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 108.8 ms