RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018755.9

Pdlim4-201, Transcript of PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdlim4, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP28,88■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa28,88■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fam122aQ9DB52 284 aa28,88■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mrc1Q61830 1456 aa28,87■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cnksr1A2A9K7 700 aa28,87■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ralbp1Q62172 648 aa28,87■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cd248Q91V98 765 aa28,87■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa28,87■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Neurod2Q62414 383 aa28,86■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 BcorQ8CGN4 1759 aa28,85■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP28,85■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ankrd50F7BE84 1390 aa28,85■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP28,84■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa28,84■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Strip1Q8C079 837 aa28,84■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa28,84■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NudcO35685 332 aaKnown RBP28,83■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Unc5clQ6R653 518 aa28,83■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Anks4bQ8K3X6 423 aa28,83■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Foxo3Q9WVH4 672 aa28,83■■■□□ 2,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Olfr247E9PVJ7 320 aa28,82■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Olfr819K7N727 320 aa28,82■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atp2b4Q6Q477 1205 aa28,82■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Susd4Q8BH32 490 aa28,82■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP28,82■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Spire2Q8K1S6 718 aa28,82■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa28,82■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa28,81■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP28,81■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cct4P80315 539 aaKnown RBP28,8■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP28,8■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa28,78■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Soga3Q6NZL0 945 aa28,78■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Hspa2P17156 633 aa28,77■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 CoilQ5SU73 570 aa28,77■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Irf9Q61179 399 aa28,77■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ttc5Q99LG4 440 aa28,77■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slc34a2Q9DBP0 697 aa28,77■■■□□ 2,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Col5a2Q3U962 1497 aa28,76■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Eva1cP58659 440 aa28,75■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gjd4Q8BSD4 364 aa28,75■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atp6v0a2P15920 856 aa28,74■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rapgefl1Q68EF8 662 aa28,74■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP28,73■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Aknad1E9Q8N6 675 aa28,72■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP28,72■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AbraQ8BUZ1 375 aa28,72■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa28,71■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa28,7■■■□□ 2,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ksr2Q3UVC0 959 aa28,7■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP28,7■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Echdc1Q9D9V3 322 aa28,7■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa28,7■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Disp3A3KFU9 1347 aa28,69■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zfp831A2ADM8 1628 aa28,69■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP28,69■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Flt4P35917 1363 aa28,69■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NpcdF8VQB8 469 aa28,68■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AK157302I3ITR1 129 aa28,68■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 CfhP06909 1234 aa28,68■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP28,68■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Isca1Q9D924 129 aa28,68■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Vamp4O70480 141 aa28,67■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 MypnQ5DTJ9 1315 aa28,67■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Myd88P22366 296 aa28,66■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 XpcP51612 930 aa28,66■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dok7Q18PE0 504 aa28,66■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP28,66■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ddx58Q6Q899 926 aa28,66■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Flt1P35969 1333 aa28,66■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fam83gQ5SWY7 812 aa28,65■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sv2bQ8BG39 683 aa28,65■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 WaslQ91YD9 501 aa28,65■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ptf1aQ9QX98 324 aa28,65■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc30Q8BVF4 654 aa28,64■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sall2Q9QX96 1004 aa28,64■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa28,64■■■□□ 2,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm6268A2A3U9 297 aa28,63■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Chl1P70232 1209 aa28,63■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Map3k9Q3U1V8 1077 aa28,63■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fkbp5Q64378 456 aa28,63■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Stk32bQ9JJX8 414 aa28,63■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kank1E9Q238 1360 aa28,62■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP28,62■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Psd3Q2PFD7 1037 aa28,62■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Map3k2Q61083 619 aa28,62■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Foxo4Q9WVH3 505 aa28,62■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp2ab1S4R196 498 aa28,62■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Arap2Q8BZ05 1703 aa28,62■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ttc41Q692V3 1318 aa28,62■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp2d11P24457 504 aa28,61■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ttc14Q9CSP9 761 aa28,61■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp19a1P28649 503 aa28,6■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ppm1mQ8BU27 406 aa28,6■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Stard3nlQ9DCI3 235 aa28,6■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa28,6■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cops6O88545 324 aa28,59■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 GptQ8QZR5 496 aa28,59■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP28,59■■■□□ 2,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cwc25Q9DBF7 416 aa28,59■■■□□ 2,17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 71,5 ms