RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CLDND1Q9NY35 253 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TRBC2A0A5B9 178 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CSO75390 466 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CD160O95971 181 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 APODP05090 189 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PRKAR1AP10644 381 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.352e-6■■■□□ 17.8
NEDD9-216ENST00000620854 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.352e-6■■□□□ 11.5
NEDD9-216ENST00000620854 AOAHP28039 575 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CSNK1DP48730 415 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 DOC2AQ14183 400 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SAXO2Q658L1 398 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 MZT2AQ6P582 158 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PDZD3Q86UT5 571 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 MMP21Q8N119 569 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 Q8N402 240 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF366Q8N895 744 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 UBE2E3Q969T4 207 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TESCQ96BS2 214 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 AP2M1Q96CW1 435 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CRELD1Q96HD1 420 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CASD1Q96PB1 797 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR51B5Q9H339 312 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 BEX1Q9HBH7 125 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 WBP1LQ9NX94 342 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CIB4A0PJX0 185 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TLR4O00206 839 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CD22P20273 847 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ACRV1P26436 265 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 DGKGP49619 791 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CRISP1P54107 249 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PSPHP78330 225 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CAP1Q01518 475 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LGALS3BPQ08380 585 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 MGAT3Q09327 533 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 BIKQ13323 160 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RAB33AQ14088 237 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 DCST1Q5T197 706 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 C17orf64Q86WR6 236 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 APCDD1Q8J025 514 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SLC9A6Q92581 669 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GAL3ST1Q99999 423 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ACER3Q9NUN7 267 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ING3Q9NXR8 418 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 C5AR2Q9P296 337 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ALG5Q9Y673 324 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PLA2G10O15496 165 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 COCHO43405 550 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RPN2P04844 631 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RB1P06400 928 aa6.62□□□□□ -1.35
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