RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB44Q8NCP5 570 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 STKLD1Q8NE28 680 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52K1Q8NGK4 314 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CD99L2Q8TCZ2 262 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ARNTL2Q8WYA1 636 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 INPP5DQ92835 1189 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A28Q96A46 364 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
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CAPNS1-210ENST00000590211 AGAP3Q96P47 875 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SEPHS2Q99611 448 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 RBBP8Q99708 897 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CPNE1Q99829 537 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SEMA3CQ99985 751 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 IL22Q9GZX6 179 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM234AQ9H0X4 552 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCG8Q9H221 673 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FN3KQ9H479 309 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM96AQ9H5X1 160 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MYNNQ9NPC7 610 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 THSD1Q9NS62 852 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ASB6Q9NWX5 421 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 COMMD8Q9NX08 183 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM161AQ9NX61 479 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 P4HTMQ9NXG6 502 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF186Q9NXI6 227 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 DONSONQ9NYP3 566 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 DCDC2Q9UHG0 476 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXW2Q9UKT8 454 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 VANGL2Q9ULK5 521 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CHKBQ9Y259 395 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PLLPQ9Y342 182 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CHD5Q8TDI0 1954 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 OBSL1O75147 1896 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 GBF1Q92538 1859 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0G2JND7 137 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 RGSL1A5PLK6 1076 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6C75A6NL08 312 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 A6NNC1 897 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 E9PAM4 449 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 I3L1I5 382 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 I6L893 689 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CHUKO15111 745 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MATN3O15232 486 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MGRN1O60291 552 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 UGT1A9O60656 530 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 OAZ2O95190 189 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 JCHAINP01591 159 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 BPGMP07738 259 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4Q2P0C623 313 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 VCLP18206 1134 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 EPORP19235 508 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNA2P20248 432 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CD22P20273 847 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FRKP42685 505 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEA11P43364 429 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 RABIFP47224 123 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ASCL1P50553 236 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MNAT1P51948 309 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 LIMK2P53671 638 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PRMT2P55345 433 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNJ2P63252 427 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBA4AP68366 448 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CRADDP78560 199 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE1BQ01064 536 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SMARCB1Q12824 385 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 STX3Q13277 289 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TNK1Q13470 666 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 RIPK1Q13546 671 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CHI3L2Q15782 390 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 DECR1Q16698 335 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 UGP2Q16851 508 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFB115Q30KQ5 88 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC153Q494R4 210 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CLLU1OSQ5K130 101 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 KCTD11Q693B1 232 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3.95□□□□□ -1.78
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