RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CBY3	A6NI87	242 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557		J3QKU1	62 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	B4GAT1	O43505	415 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TNF	P01375	233 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	FGF1	P05230	155 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	LIPC	P11150	499 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	SKIL	P12757	684 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CTSE	P14091	401 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CCNB1	P14635	433 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	FER	P16591	822 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	IL4R	P24394	825 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CD1C	P29017	333 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	GNPDA1	P46926	289 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	SUOX	P51687	545 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	ARSE	P51690	589 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CLCNKA	P51800	687 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	AP1S1	P61966	158 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	BCL2L1	Q07817	233 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	IL10RB	Q08334	325 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	NR1D2	Q14995	579 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	FCN2	Q15485	313 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	MED8	Q96G25	268 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557		A6NCN8	305 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	DUX1	O43812	170 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PGLS	O95336	258 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	AMBP	P02760	352 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	HLA-DQB2	P05538	268 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	IVL	P07476	585 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TPM2	P07951	284 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	MMP2	P08253	660 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	THRA	P10827	490 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	GZMA	P12544	262 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	LIF	P15018	202 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PCK1	P35558	622 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TIMP3	P35625	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	HCAR3	P49019	387 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TAS2R40	P59535	323 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF235	Q14590	738 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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