RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	GID8	Q9NWU2	228 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SPEG	Q15772	3267 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CFAP54	Q96N23	3096 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OR2W5	A6NFC9	320 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MRAS	O14807	208 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ATP1B1	P05026	303 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OTX2	P32243	289 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PGD	P52209	483 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ART3	Q13508	389 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NFYC	Q13952	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SSPN	Q14714	243 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CEBPE	Q15744	281 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DTX1	Q86Y01	620 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TREML1	Q86YW5	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SHISA5	Q8N114	240 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NUDT8	Q8WV74	236 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	FGF11	Q92914	225 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	RCN3	Q96D15	328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NSL1	Q96IY1	281 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	LPAR4	Q99677	370 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	VPS4A	Q9UN37	437 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658		A8MUA0	341 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CAPN14	A8MX76	684 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	C17orf105	B2RV13	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PEX12	O00623	359 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	AIM2	O14862	343 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CALB2	P22676	271 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MMP11	P24347	488 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	GALNS	P34059	522 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NUDT2	P50583	147 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	FOXL2	P58012	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PRR5	P85299	388 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MLC1	Q15049	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	COQ5	Q5HYK3	327 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	RIT1	Q92963	219 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MOAP1	Q96BY2	351 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MAGED4	Q96JG8	741 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF681	Q96N22	645 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NPAS2	Q99743	824 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NDE1	Q9NXR1	346 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658		A0A096LPI6	279 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PS29	197 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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