RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	PLP2	Q04941	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB32	Q13637	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CASP8	Q14790	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SGCB	Q16585	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TAZ	Q16635	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636		Q6ZS92	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HORMAD1	Q86X24	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MNT	Q99583	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	COQ7	Q99807	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EXO5	Q9H790	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636		H7C1Q1	480 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC188	H7C350	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CCL21	O00585	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PDXK	O00764	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ACSL4	O60488	711 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	RASSF9	O75901	435 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	WISP2	O76076	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CPNE6	O95741	557 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	IL1B	P01584	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FH	P07954	510 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CLU	P10909	449 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SPTB	P11277	2137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	HK1	P19367	917 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CD1C	P29017	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	AKT2	P31751	481 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CA5A	P35218	305 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PCGF2	P35227	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SPAM1	P38567	509 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CDKN1B	P46527	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNJ5	P48544	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	DSTN	P60981	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	DEFA6	Q01524	100 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MC2R	Q01718	297 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	XRCC4	Q13426	336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PIM3	Q86V86	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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