RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522519.5

MSC-AS1-208, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 1,537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRMT3O60678 531 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 SLC22A3O75751 556 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 CIB2O75838 187 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 ITGB2P05107 769 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 G6PDP11413 515 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 ACPPP15309 386 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 HSD17B7P56937 341 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 UFM1P61960 85 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIAA0040Q15053 153 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TEX37Q96LM6 180 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 MCM8Q9UJA3 840 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.71□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 FAM234BA2RU67 622 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 BLACEA4D250 179 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARGFXA6NJG6 315 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 CLDN4O14493 209 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PROM1O43490 865 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PCDH7O60245 1069 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 SEC22BO75396 215 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 COX6A1P12074 109 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 MAOAP21397 527 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 IL12AP29459 219 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 MAPK12P53778 367 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 KCNK10P57789 538 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 NSDHLQ15738 373 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 CPZQ66K79 652 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 C18orf63Q68DL7 685 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 BORAQ6PGQ7 559 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 RETREG3Q86VR2 466 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 ROPN1LQ96C74 230 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 SPDL1Q96EA4 605 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 VPS50Q96JG6 964 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 FCRL1Q96LA6 429 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 A0A1W2PP18 115 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 A0A1W2PR48 441 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 DYTNA2CJ06 578 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 ANGPT2O15123 496 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 AIFM1O95831 613 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 NR2F6P10588 404 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 MAPK1P28482 360 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 RHDQ02161 417 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 SLC13A2Q13183 592 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 SNCBQ16143 134 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TBR1Q16650 682 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 DCAF10Q5QP82 559 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 LIX1Q8N485 282 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TTC9Q92623 222 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 EXTL1Q92935 676 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 C9JVG2 144 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 CTNSO60931 367 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PDE5AO76074 875 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 HPP00738 406 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRPS2P11908 318 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PCSK2P16519 638 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 RRADP55042 308 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PSME3P61289 254 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 CHAF1BQ13112 559 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PTGR1Q14914 329 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PCOLCEQ15113 449 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms