RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CISD3P0C7P0 127 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PVRP15151 417 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IDSP22304 550 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGHV1-2P23083 117 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 POU3F4P49335 361 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ASCL1P50553 236 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NAGLUP54802 743 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MFAP4P55083 255 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RAG2P55895 527 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EMC2Q15006 297 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDKN3Q16667 212 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACER2Q5QJU3 275 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FUT10Q6P4F1 479 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa-0.39□□□□□ -2.47
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC43A2Q8N370 569 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKRD42Q8N9B4 389 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KCTD6Q8NC69 237 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CAMKVQ8NCB2 501 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DUSP18Q8NEJ0 188 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR6J1Q8NGC5 347 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR1K1Q8NGR3 316 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKRD49Q8WVL7 239 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SMPDL3AQ92484 453 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TVP23CQ96ET8 276 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MUC13Q9H3R2 512 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MARCH5Q9NX47 278 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TAGLN3Q9UI15 199 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDH10Q9Y6N8 788 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BAHCC1Q9P281 2608 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRP4O75096 1905 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRC1O43663 620 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR6A2O95222 327 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLU7O95391 586 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PARNO95453 639 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEMG1P04279 462 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MMP10P09238 476 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUDT17P0C025 328 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UCP2P55851 309 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BCL2L1Q07817 233 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC39A6Q13433 755 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MORC3Q14149 939 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BECN1Q14457 450 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BRD3Q15059 726 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IRF4Q15306 451 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CPLX4Q7Z7G2 160 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF100Q8IYN0 542 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ALLCQ8N6M5 410 aa-0.4□□□□□ -2.47
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 LPGAT1Q92604 370 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TAF4BQ92750 862 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PYCR2Q96C36 320 aa-0.4□□□□□ -2.47
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 C9orf85Q96MD7 179 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FEM1AQ9BSK4 669 aa-0.4□□□□□ -2.47
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF350Q9GZX5 532 aa-0.4□□□□□ -2.47
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 SMC3Q9UQE7 1217 aa-0.4□□□□□ -2.47
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLIN1O60240 522 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZBED4O75132 1171 aa-0.41□□□□□ -2.48
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 RBMY1CP0DJD4 496 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 XBP1P17861 261 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPY1RP25929 384 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GDI1P31150 447 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DLSTP36957 453 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR3A3P47888 321 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCR9P51686 369 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC17A1Q14916 467 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PTGISQ16647 500 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLPP4Q5VZY2 271 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARSKQ6UWY0 536 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CYP26C1Q6V0L0 522 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR10S1Q8NGN2 331 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DCLRE1BQ9H816 532 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UBN1Q9NPG3 1134 aa-0.41□□□□□ -2.48
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