RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-208	ENST00000504294	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	BBS4	Q96RK4	519 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SORT1	Q99523	831 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	EBPL	Q9BY08	206 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ASIC5	Q9NY37	505 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	TMEM233	B4DJY2	109 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SASH3	O75995	380 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	TGDS	O95455	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	IFI6	P09912	130 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	LBP	P18428	481 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	OCRL	Q01968	901 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ID2	Q02363	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	MAP4K2	Q12851	820 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	RAPSN	Q13702	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SLC15A4	Q8N697	577 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	NUBPL	Q8TB37	319 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	PSMF1	Q92530	271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	NCLN	Q969V3	563 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	MAGEB18	Q96M61	343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	PRODH2	Q9UF12	536 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	CAPN14	A8MX76	684 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294		B8ZZF3	427 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	BCKDHA	P12694	445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	PRPS1L1	P21108	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ARRB2	P32121	409 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	GPR143	P51810	404 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	DCAF7	P61962	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	INA	Q16352	499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	OR2T11	Q8NH01	316 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF675	Q8TD23	568 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24	2e-7	■■■■□ 21.8
SH3BP2-208	ENST00000504294	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ITPR1	Q14643	2758 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	OR5H15	A6NDH6	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	TTC36	A6NLP5	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ATP6AP2	O75787	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	DDAH2	O95865	285 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SDC1	P18827	310 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	MLF1	P58340	268 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	RNF4	P78317	190 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	FUT7	Q11130	342 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	CEBPE	Q15744	281 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	MPEG1	Q2M385	716 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	OGFOD2	Q6N063	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	OPN5	Q6U736	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	TAGAP	Q8N103	731 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	SHISA5	Q8N114	240 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-208	ENST00000504294	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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