RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	SMU1	Q2TAY7	513 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	LIPJ	Q5W064	366 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ATG9B	Q674R7	924 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF425	Q6IV72	752 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	TEX9	Q8N6V9	391 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	NEIL2	Q969S2	332 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	PYCR2	Q96C36	320 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	C19orf60	Q96EN9	201 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	C12orf66	Q96MD2	445 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	FOPNL	Q96NB1	174 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	IL17F	Q96PD4	163 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CCT7	Q99832	543 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	HGH1	Q9BTY7	390 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	NT5DC2	Q9H857	520 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ASIC5	Q9NY37	505 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	WWOX	Q9NZC7	414 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ASF1A	Q9Y294	204 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717		U3KQA8	63 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SCN2A	Q99250	2005 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2W5	A6NFC9	320 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717		J3KTA2	159 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	MANBA	O00462	879 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	PCDH17	O14917	1159 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	AQP9	O43315	295 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CDC14B	O60729	498 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CLDN9	O95484	217 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CAPN1	P07384	714 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CD1E	P15812	388 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CKMT2	P17540	419 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	PI3	P19957	117 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2AD	P20671	130 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	EPHA3	P29320	983 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	HNF4A	P41235	474 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ACTR1B	P42025	376 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP4B	P51164	291 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CCNG1	P51959	295 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	C21orf58	P58505	322 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ACTR1A	P61163	376 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	REEP5	Q00765	189 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	RELA	Q04206	551 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	NAE1	Q13564	534 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	DOC2A	Q14183	400 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	GPR18	Q14330	331 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CFAP157	Q5JU67	520 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC25A45	Q8N413	288 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		5.41	□□□□□ -1.54

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