RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 DOK4Q8TEW6 326 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SLX1AQ9BQ83 275 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 EBPLQ9BY08 206 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 LRFN1Q9P244 771 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 HEY2Q9UBP5 337 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 COPS7AQ9UBW8 275 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CES1P1Q9UKY3 287 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 VPS4AQ9UN37 437 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ERVK-19Q9WJR5 959 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CCL27Q9Y4X3 112 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.08□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TMEM233B4DJY2 109 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 AZIN1O14977 448 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 OR10H2O60403 315 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 GUCY1B2O75343 617 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ERLIN1O75477 346 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CRCPO75575 148 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 OR2J2O76002 312 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZFAND5O76080 213 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CLPSP04118 112 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 BPGMP07738 259 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SLC35E2P0CK97 266 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CPMP14384 443 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 GALNSP34059 522 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CYB561P49447 251 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 HLCSP50747 726 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TDGF1P3P51864 188 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 PMP22Q01453 160 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 DUSP2Q05923 314 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NR6A1Q15406 480 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 LRIG3Q6UXM1 1119 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 RNF165Q6ZSG1 346 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 C9orf40Q8IXQ3 194 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 OR6Y1Q8NGX8 325 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 OR8K3Q8NH51 312 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FAR1Q8WVX9 515 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 RIT1Q92963 219 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 KLHL29Q96CT2 875 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 PGM2Q96G03 612 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 PKNOX2Q96KN3 472 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ART5Q96L15 291 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CNPPD1Q9BV87 410 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CENPHQ9H3R5 247 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 KLHL1Q9NR64 748 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SIRT5Q9NXA8 310 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MYOTQ9UBF9 498 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FIS1Q9Y3D6 152 aa13.07□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CLEC18AA5D8T8 446 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NPIPB8E9PQR5 432 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SLC25A12O75746 678 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CBX6O95503 412 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 IL3P08700 152 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CT62P0C5K7 136 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CD46P15529 392 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 PRPH2P23942 346 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SERPINB4P48594 390 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ALDH9A1P49189 494 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 BTKQ06187 659 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZNF763Q0D2J5 394 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 IMPG1Q17R60 797 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZNF750Q32MQ0 723 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CES4AQ5XG92 561 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CLEC18BQ6UXF7 455 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CROCCP2Q86T23 111 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TMEM156Q8N614 296 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 BCORP1Q8N888 145 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CLEC18CQ8NCF0 446 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 OR4K14Q8NGD5 310 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 OR2T11Q8NH01 316 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NUBPLQ8TB37 319 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 C5orf34Q96MH7 638 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 RASL10BQ96S79 203 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FAIM2Q9BWQ8 316 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TUBB1Q9H4B7 451 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CXorf21Q9HAI6 301 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 OLAHQ9NV23 265 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NAV2Q8IVL1 2488 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 GOLGA6L10A6NI86 522 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 WWP2O00308 870 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 719.2 ms