RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SGF29	Q96ES7	293 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	PINK1	Q9BXM7	581 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	PFAS	O15067	1338 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ABCC4	O15439	1325 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CCER2	I3L3R5	266 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	PDHX	O00330	501 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	HP	P00738	406 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SCG2	P13521	617 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	NF2	P35240	595 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SLC1A3	P43003	542 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	BACE1	P56817	501 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	TSPY1	Q01534	308 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SCN1B	Q07699	218 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CETN1	Q12798	172 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	GPR50	Q13585	617 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	PET117	Q6UWS5	81 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	MR1	Q95460	341 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	STRADB	Q9C0K7	418 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	GPR132	Q9UNW8	380 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CNTNAP1	P78357	1384 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ABCC12	Q96J65	1359 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	P2RX6	O15547	441 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ST8SIA3	O43173	380 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	GPRIN2	O60269	458 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	FGF19	O95750	216 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CD1D	P15813	335 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	EPS15	P42566	896 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	IER3	P46695	156 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	NPBWR1	P48145	328 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	RPAIN	Q86UA6	219 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	VSIG1	Q86XK7	387 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SLC43A2	Q8N370	569 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SMPDL3A	Q92484	453 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SLC35C1	Q96A29	364 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	WDR41	Q9HAD4	459 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	KCNK13	Q9HB14	408 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	GPR83	Q9NYM4	423 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF609	O15014	1411 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	KBTBD13	C9JR72	458 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CTDSPL	O15194	276 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	UFL1	O94874	794 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	OR6B1	O95007	311 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	REN	P00797	406 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	IGKV5-2	P06315	115 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	MELTF	P08582	738 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	GP9	P14770	177 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ACY1	Q03154	408 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	ABR	Q12979	859 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	PEX6	Q13608	980 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	CASC4	Q6P4E1	433 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	SMYD1	Q8NB12	490 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NFU1-209	ENST00000474230	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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