RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MAST4	O15021	2626 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PS29	197 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880		G3V3Y1	287 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PCDH7	O60245	1069 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SPAG7	O75391	227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	OR6B1	O95007	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MEOX1	P50221	254 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	XK	P51811	444 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PLGLB1	Q02325	96 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MDGA2	Q7Z553	956 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MMP21	Q8N119	569 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	RDH11	Q8TC12	318 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FBXL20	Q96IG2	436 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	RASL10B	Q96S79	203 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	EBPL	Q9BY08	206 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CENPH	Q9H3R5	247 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf226	A1L170	272 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PEX1	O43933	1283 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT17	P0C025	328 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35E2	P0CK97	266 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	HSD3B1	P14060	373 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	HSD3B2	P26439	372 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINB3	P29508	390 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PTGER1	P34995	402 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CASP6	P55212	293 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PER3	P56645	1201 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	LIPM	Q5VYY2	423 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	OPN5	Q6U736	354 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FAM13C	Q8NE31	585 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ACPT	Q9BZG2	426 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PSME2	Q9UL46	239 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	WISP2	O76076	250 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	IL3	P08700	152 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SSTR4	P31391	388 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FOXA1	P55317	472 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SPIN4	Q56A73	249 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CAVIN3	Q969G5	261 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	APIP	Q96GX9	242 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	OXSM	Q9NWU1	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CDK2AP1	O14519	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880		P04436	131 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CPM	P14384	443 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ABO	P16442	354 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJB13	P59910	316 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	NAA20	P61599	178 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	HSF1	Q00613	529 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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