RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470563.5

RBM39-227, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 3

Gene RBM39, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-227	ENST00000470563	CYP2A7	P20853	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CDH3	P22223	829 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CALB2	P22676	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	JAK1	P23458	1154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	GAS1	P54826	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	IL9R	Q01113	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ANO5	Q75V66	913 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ART4	Q93070	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SPX	Q9BT56	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	8e-14	■□□□□ 9.2
RBM39-227	ENST00000470563	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CTDSPL	O15194	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	RIPK2	O43353	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CYTH3	O43739	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ECE2	O60344	883 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ATP9A	O75110	1047 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	GAS8	O95995	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	VTN	P04004	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	GZMA	P12544	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ENPEP	Q07075	957 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CETN1	Q12798	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NDN	Q99608	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	AZI2	Q9H6S1	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ASB3	Q9Y575	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563		A0A087X0K7	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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