RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 RNF224P0DH78 156 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 SERPINB3P29508 390 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 SOX3P41225 446 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 NAA20P61599 178 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 BTKQ06187 659 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 SPRED3Q2MJR0 410 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 GFRALQ6UXV0 394 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 MDGA2Q7Z553 956 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 OR5L2Q8NGL0 311 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 HPF1Q9NWY4 346 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 SLC17A7Q9P2U7 560 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 PTPN13Q12923 2485 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 EML6Q6ZMW3 1958 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 HECTD1Q9ULT8 2610 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 ASPDHA6ND91 283 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 CRCPO75575 148 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 XKP51811 444 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 RAE1P78406 368 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 FAM111AQ96PZ2 611 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 SEC14L3Q9UDX4 400 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 RAB21Q9UL25 225 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 CROCCQ5TZA2 2017 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 C1orf226A1L170 272 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 PCDH7O60245 1069 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 UNC5CO95185 931 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 CREB1P16220 341 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 ALDH9A1P49189 494 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 ACSM2AQ08AH3 577 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 ASPHQ12797 758 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 ACSM2BQ68CK6 577 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 SLC48A1Q6P1K1 146 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 SSC4DQ8WTU2 575 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 MCM8Q9UJA3 840 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 CES1P1Q9UKY3 287 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
FBXO18-208ENST00000470089 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 GPR85P60893 370 aa27.13■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 SPDYAQ5MJ70 313 aa27.13■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 RNF111Q6ZNA4 994 aa27.13■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 SULF2Q8IWU5 870 aa27.13■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 GAL3ST4Q96RP7 486 aa27.13■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 EBPLQ9BY08 206 aa27.13■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 CXorf21Q9HAI6 301 aa27.13■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 TRIM13O60858 407 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 CLPSP04118 112 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 CT62P0C5K7 136 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 CPMP14384 443 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 NT5EP21589 574 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 ALDH3A1P30838 453 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 SSTR4P31391 388 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 GALNSP34059 522 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 PTGER1P34995 402 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 RFC3P40938 356 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 MEOX1P50221 254 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 KRT71Q3SY84 523 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 SPIN4Q56A73 249 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 RNFT1Q5M7Z0 435 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 CLEC6AQ6EIG7 209 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 FAM180BQ6P0A1 224 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 GALNT12Q8IXK2 581 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 NUBPLQ8TB37 319 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 TCP10LQ8TDR4 215 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 ZBTB9Q96C00 473 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 KLHL29Q96CT2 875 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 SMC6Q96SB8 1091 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 MECRQ9BV79 373 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 TMEM109Q9BVC6 243 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 FAIM2Q9BWQ8 316 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 HEY2Q9UBP5 337 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 SLC5A6Q9Y289 635 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 SERTM1A2A2V5 107 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 NPIPA5E9PKD4 350 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 H3BQF6 201 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 PEX1O43933 1283 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 IL3P08700 152 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 PORP16435 677 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 FEN1P39748 380 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 SLC37A1P57057 533 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF844Q08AG5 666 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 IMPG1Q17R60 797 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 SLC29A4Q7RTT9 530 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 PSD4Q8NDX1 1056 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 NPIPA1Q9UND3 350 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 DUSP2Q05923 314 aa27.1■■□□□ 1.93
FBXO18-208ENST00000470089 PIGGQ5H8A4 983 aa27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms