RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 DPH1Q9BZG8 443 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR41Q9HAD4 459 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 MYNNQ9NPC7 610 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 C5AR2Q9P296 337 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 PADI2Q9Y2J8 665 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 PCSK5Q92824 1860 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PS29 197 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 A8MUA0 341 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 UBDO15205 165 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 NKX2-8O15522 239 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 FGF17O60258 216 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 CTNSO60931 367 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ALOX12BO75342 701 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 GUCY1B2O75343 617 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 CREG1O75629 220 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 CD63P08962 238 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 PRPS2P11908 318 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 EPHA1P21709 976 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ITPKBP27987 946 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ARFIP2P53365 341 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 HSD17B7P56937 341 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 FOLH1Q04609 750 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 IL10RAQ13651 578 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 SSPNQ14714 243 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 PTGR1Q14914 329 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 SMU1Q2TAY7 513 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 OGFOD2Q6N063 350 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 AMER2Q8N7J2 671 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 DOK4Q8TEW6 326 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 STARD8Q92502 1023 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 TANKQ92844 425 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 C8orf44Q96CB5 159 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 RILPQ96NA2 401 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 CATSPER2Q96P56 530 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 AIG1Q9NVV5 245 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ASIC5Q9NY37 505 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf226A1L170 272 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 F8W735 103 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 MASP2O00187 686 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 SOCS6O14544 535 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFB5O43674 189 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR75O95800 540 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKAR1AP10644 381 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 DRD2P14416 443 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 DDCP20711 480 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 PIK3R1P27986 724 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP2R1BP30154 601 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 GSTM5P46439 218 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ASMTP46597 345 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 CLDN8P56748 225 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 UFM1P61960 85 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 STX4Q12846 297 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.88□□□□□ -1.15
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS6KA2Q15349 733 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms