RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PS29 197 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf226A1L170 272 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 NPIPA5E9PKD4 350 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 RNF224P0DH78 156 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 GALNSP34059 522 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 XKP51811 444 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 C4orf17Q53FE4 359 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 TRABD2AQ86V40 505 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 SULF2Q8IWU5 870 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 C9orf40Q8IXQ3 194 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 NUBPLQ8TB37 319 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 LGALS13Q9UHV8 139 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 NPIPA1Q9UND3 350 aa22.22■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 LRRTM2O43300 516 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 PEX1O43933 1283 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 CRCPO75575 148 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 WISP2O76076 250 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 STSP08842 583 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF24P17028 368 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 MEOX1P50221 254 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 HMGCS1Q01581 520 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ASPHQ12797 758 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 LIPMQ5VYY2 423 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 SCIMPQ6UWF3 145 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 RNF111Q6ZNA4 994 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 APOPT1Q96IL0 206 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 FAIM2Q9BWQ8 316 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 MCM8Q9UJA3 840 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 PLLPQ9Y342 182 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 H3BQF6 201 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 LDLRP01130 860 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 CPMP14384 443 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 FOXA1P55317 472 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 RBPJQ06330 500 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 ACSM2AQ08AH3 577 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 MPEG1Q2M385 716 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 KRTCAP3Q53RY4 240 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SPIN4Q56A73 249 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 PIGGQ5H8A4 983 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SLC48A1Q6P1K1 146 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 OPN5Q6U736 354 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SLC29A4Q7RTT9 530 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GALNT12Q8IXK2 581 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 MMP21Q8N119 569 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 BANPQ8N9N5 519 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 POGLUT1Q8NBL1 392 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 PSD4Q8NDX1 1056 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GPR137Q96N19 417 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GAL3ST4Q96RP7 486 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 CXorf21Q9HAI6 301 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 MKS1Q9NXB0 559 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 CES1P1Q9UKY3 287 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 PSME2Q9UL46 239 aa22.2■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 PCDH7O60245 1069 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 NT5EP21589 574 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 ALDH9A1P49189 494 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SLC37A1P57057 533 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GPR85P60893 370 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 BTKQ06187 659 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF750Q32MQ0 723 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 RNFT1Q5M7Z0 435 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 RTL4Q6ZR62 310 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SIAH3Q8IW03 269 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SLC22A8Q8TCC7 542 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 APIPQ96GX9 242 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.19■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1B0GUH1 482 aa22.18■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SERTM1A2A2V5 107 aa22.18■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 WIPF3A6NGB9 483 aa22.18■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 RFC3P40938 356 aa22.18■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 PER3P56645 1201 aa22.18■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 PCLAFQ15004 111 aa22.18■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.18■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 MREGQ8N565 214 aa22.18■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 KLHL29Q96CT2 875 aa22.18■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SGCZQ96LD1 299 aa22.18■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 OR6C76A6NM76 312 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 ASNA1O43681 348 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM13O60858 407 aa22.17■■□□□ 1.14
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