RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSDMBQ8TAX9 411 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLMPQ8WWB7 406 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 THAP4Q8WY91 577 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPT1BQ92523 772 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAPZA3Q96KX2 299 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD180Q99467 661 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACAT2Q9BWD1 397 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A18Q9H1K4 315 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MVB12BQ9H7P6 319 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM60AQ9NP50 221 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 STARD5Q9NSY2 213 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPHA6Q9UF33 1036 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNPTGQ9UJJ9 305 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCND3Q9UK17 655 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB21Q9UL25 225 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX7Q9UNH6 387 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTRCQ9Y297 605 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa4.22□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC5A10A0PJK1 596 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP27XA6NNY8 438 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 C9J4A7 227 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 E5RI56 91 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 E7EQ34 232 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD3O43242 534 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF749O43361 778 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNJ13O60928 360 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFS3O75489 264 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2B3O76000 313 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 JTBO76095 146 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 AP2A2O94973 939 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT14P02533 472 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOA4P06727 396 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPBGLP0DKB5 382 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBSLP0DN79 551 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPSB2P20231 275 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 FMO4P31512 558 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBSP35520 551 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC1A2P43004 574 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTPAP49638 278 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PMS2P54278 862 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLLT10P55197 1068 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPP1Q00013 466 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MC1RQ01726 317 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCF4Q15080 339 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPSAB1Q15661 275 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGFBP7Q16270 282 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 KMT5CQ86Y97 462 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS58Q8IYP2 241 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC22A15Q8IZD6 547 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 DSELQ8IZU8 1212 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5K2Q8NHB8 316 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 DTX3LQ8TDB6 740 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 HEXDCQ8WVB3 486 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 WBP1Q96G27 269 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAR2Q96K12 515 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CATSPER2Q96P56 530 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2A14Q96R47 310 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RANBP9Q96S59 729 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDNQ99608 321 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSSK1BQ9BXA7 367 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRY4Q9C004 299 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB33BQ9H082 229 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDCP1Q9H5V8 836 aa4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms