RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDAP32320 146 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLP1RP43220 463 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 EMDP50402 254 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST3GAL4Q11206 333 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 MERTKQ12866 999 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB30Q15771 203 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC144BQ3MJ40 725 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAF7LQ5H9L4 462 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5M10Q6IEU7 315 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR59Q6PJI9 974 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACP7Q6ZNF0 438 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMCX2Q7L311 632 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLRP14Q86W24 1093 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX32Q86XE0 403 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM114A1Q8IWE2 563 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF645Q8N7E2 425 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFP41Q8N8Y5 198 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 POGLUT1Q8NBL1 392 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2T33Q8NG76 320 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 GSDMBQ8TAX9 411 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD99L2Q8TCZ2 262 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 L3HYPDHQ96EM0 354 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 LURAP1Q96LR2 239 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF5Q99942 180 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC3Q9BQI4 270 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF416Q9BWM5 594 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 MINDY3Q9H8M7 445 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NMUR1Q9HB89 426 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPB41L5Q9HCM4 733 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBQLN4Q9NRR5 601 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D13Q9NVG8 400 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 OBP2AQ9NY56 170 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR12D3Q9UGF7 316 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXW11Q9UKB1 542 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCINQ9Y6U3 715 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 U3KQA8 63 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 U3KQK5 164 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPHP3Q7Z494 1330 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHD1A6NEE1 506 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIPT2A6NK58 231 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC17A2O00624 439 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGS12O14924 1447 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARPC2O15144 300 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIGLEC5O15389 551 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMD3O43242 534 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPIP5K2O43314 1243 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGK1P00558 417 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 FCGR3AP08637 254 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALPIP09923 528 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV1-2P23083 117 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACP1P24666 158 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 GARSP41250 739 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGDIAP52565 204 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGDIBP52566 201 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 UCP2P55851 309 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRB1P82279 1406 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLC1Q07866 573 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF415Q09FC8 603 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMOD3Q0VAK6 560 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 NFIL3Q16649 462 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2B11Q5JQS5 317 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM255AQ5JRV8 349 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CBWD5Q5RIA9 395 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF220Q5VTB9 566 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARID2Q68CP9 1835 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASP12Q6UXS9 341 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP24Q8N264 748 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC191Q8NCU4 936 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CATSPER1Q8NEC5 780 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINS1Q8NG48 757 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2AP1Q8NGE2 309 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRYGNQ8WXF5 182 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM81BQ96LP2 452 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-172P-201ENST00000411000 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
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