RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CEP44	Q9C0F1	390 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	KLHL31	Q9H511	634 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ABCB9	Q9NP78	766 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918		V9GYH0	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	COL4A3	Q01955	1670 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A1W2PQ09	198 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ASNA1	O43681	348 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC28A2	O43868	658 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CCNK	O75909	580 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	NCR1	O76036	304 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	SNX4	O95219	450 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	MED26	O95402	600 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	RHCE	P18577	417 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	LAG3	P18627	525 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC15A1	P46059	708 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	PCYT1A	P49585	367 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	DGKG	P49619	791 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	XK	P51811	444 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CDC20	Q12834	499 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	SPHAR	Q15513	63 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	MLIP	Q5VWP3	458 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	IQCH	Q86VS3	1027 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	TM9SF4	Q92544	642 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	NUS1	Q96E22	293 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	TXNDC15	Q96J42	360 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CEP19	Q96LK0	163 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	COQ10A	Q96MF6	247 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	NLN	Q9BYT8	704 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	UCK2	Q9BZX2	261 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	NEK6	Q9HC98	313 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	EQTN	Q9NQ60	294 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CLN6	Q9NWW5	311 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CNIH4	Q9P003	139 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	OR1A2	Q9Y585	309 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	SPTB	P11277	2137 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	TAF4	O00268	1085 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	DPM1	O60762	260 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CDRT1	O95170	752 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	PAPLN	O95428	1278 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	PCCB	P05166	539 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	MMP11	P24347	488 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ACADL	P28330	430 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	BSG	P35613	385 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	SOX9	P48436	509 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	HMGA2	P52926	109 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	CLDN2	P57739	230 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	OR2B6	P58173	313 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	PRKCD	Q05655	676 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	DHCR24	Q15392	516 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF77	Q15935	545 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM129C	Q86XR2	697 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CAGE1-203	ENST00000379918	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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