RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GPR151Q8TDV0 419 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 NACC2Q96BF6 587 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 OMA1Q96E52 524 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM80Q96HE8 168 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RADILQ96JH8 1075 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FCRL1Q96LA6 429 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC140Q96MF4 163 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 KCNC2Q96PR1 638 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 VPS35Q96QK1 796 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FEVQ99581 238 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TCF25Q9BQ70 676 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 P2RY12Q9H244 342 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PDFQ9HBH1 243 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC1BQ9P126 229 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MEGF11A6BM72 1044 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MYL12BO14950 172 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN9O75954 239 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FGF19O95750 216 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LRG1P02750 347 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HSD3B1P14060 373 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MYL12AP19105 171 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GPR15P49685 360 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HMGA2P52926 109 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ10P78508 379 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF79Q15937 498 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HECTD3Q5T447 861 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ARTNQ5T4W7 220 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HACD4Q5VWC8 232 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MZT2AQ6P582 158 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 KIF18BQ86Y91 864 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SVIPQ8NHG7 77 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TPD52L3Q96J77 140 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD7Q96MP8 289 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PIGUQ9H490 435 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 NMUR1Q9HB89 426 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 VPS4AQ9UN37 437 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TLR5O60602 858 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINI2O75830 405 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TPPPO94811 219 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CBX7O95931 251 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ADAP00813 363 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 VIPP01282 170 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 IFNA7P01567 189 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 DNTTP04053 509 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 EPHA2P29317 976 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GRK5P34947 590 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PTGS2P35354 604 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN20P56880 219 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HMGCS1Q01581 520 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SPIBQ01892 262 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TWF1Q12792 350 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RAB30Q15771 203 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 BAK1Q16611 211 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TATDN3Q17R31 274 aa6.84□□□□□ -1.31
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