RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF639Q9UID6 485 aa15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC119BA6NIH7 251 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMP1P11279 417 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51A7Q8NH64 312 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 BMFQ96LC9 184 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SCGB3A2Q96PL1 93 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MEMO1Q9Y316 297 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GCGRP47871 477 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTC1P68032 377 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTA1P68133 377 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK3Q00526 305 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4N5Q8IXE1 308 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPA12BQ96MM6 686 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SERINC2Q96SA4 455 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXD1Q9GZZ0 328 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0G2JPF8 293 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ANHXE9PGG2 379 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NPIPA2E9PIF3 369 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NPIPA3F8WFD2 350 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGA5P08648 1049 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PGAM2P15259 253 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-FP30511 346 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CLRN1P58418 232 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCA11PQ4W5N1 156 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SGTBQ96EQ0 304 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RASAL1O95294 804 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CBLP22681 906 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CXCL12P48061 93 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ARF5P84085 180 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ACOT12Q8WYK0 555 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 APIPQ96GX9 242 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MUS81Q96NY9 551 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 STOML2Q9UJZ1 356 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX46H3BTG2 121 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CDRT1O95170 752 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DHRS4L1P0CG22 281 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ETFAP13804 333 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FUT4P22083 530 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM19Q96HH6 336 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D24Q9ULP9 559 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 C11orf98E9PRG8 122 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 KDM4BO94953 1096 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HCKP08631 526 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 S1PR1P21453 382 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF84P51523 738 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LCN8Q6JVE9 175 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PNCKQ6P2M8 343 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 IQCF2Q8IXL9 164 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MINDY2Q8NBR6 621 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PRAMEF2O60811 474 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR37L1O60883 481 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RLN2P04090 185 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DCDC1P59894 354 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATC1Q76KD6 591 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SARDHQ9UL12 918 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MYH10P35580 1976 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 C4AP0C0L4 1744 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ADORA3P0DMS8 318 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGA3P26006 1051 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ST3GAL4Q11206 333 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC36A3Q495N2 470 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms