RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 NUDT13Q86X67 352 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 TANKQ92844 425 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ART5Q96L15 291 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 VPS11Q9H270 941 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF358Q9NW07 568 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ASB4Q9Y574 426 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 OR14I1A6ND48 311 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 OR7A17O14581 309 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 BCKDKO14874 412 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PROM1O43490 865 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 TYK2P29597 1187 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 MAN2A2P49641 1150 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ACAP2Q15057 778 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 KLC3Q6P597 504 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 TMEM64Q6YI46 380 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 REPS1Q96D71 796 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 EXO5Q9H790 373 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 MED13LQ71F56 2210 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 A0A0G2JNJ9 132 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 AQP7O14520 342 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 UGDHO60701 494 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ACSL3O95573 720 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 GPR75O95800 540 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 FBXO45P0C2W1 286 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 GLI4P10075 376 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SSTR4P31391 388 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SLC37A1P57057 533 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ACAD11Q709F0 780 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 RIT1Q92963 219 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 LDAHQ9H6V9 325 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PROK2Q9HC23 129 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 XPR1Q9UBH6 696 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 Q9UFV3 132 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SPG11Q96JI7 2443 aa14.58□□□□□ -0.07
SYCE1-202ENST00000343131 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 A0A1B0GVC2 190 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 PHBP35232 272 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 ADH7P40394 386 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 TRPC1P48995 793 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 TRAF3Q13114 568 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 CUL3Q13618 768 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 C1orf185Q5T7R7 199 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 BICRALQ6AI39 1079 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 PHF21BQ96EK2 531 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 PCTPQ9UKL6 214 aa14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 A0A1B0GTL3 188 aa14.57□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 PGRMC2O15173 223 aa14.57□□□□□ -0.08
SYCE1-202ENST00000343131 SUSD5O60279 629 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms