RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 C18orf63Q68DL7 685 aa21.49■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 RNF175Q8N4F7 328 aa21.49■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 PAQR8Q8TEZ7 354 aa21.49■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 Q9UFV3 132 aa21.49■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 FAM215AQ9Y5M1 114 aa21.49■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 IGKV3-11P04433 115 aa21.48■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 TESK1Q15569 626 aa21.48■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 TMEM198Q66K66 360 aa21.48■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.48■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 NXNL1Q96CM4 212 aa21.48■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 ZNF597Q96LX8 424 aa21.48■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 WWTR1Q9GZV5 400 aa21.48■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 QPCTLQ9NXS2 382 aa21.48■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 EDARQ9UNE0 448 aa21.48■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC189A1A4V9 331 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 PEX19P40855 299 aa21.47■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 RPP38P78345 283 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 PCDH1Q08174 1060 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 DLG1Q12959 904 aa21.47■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 SPRED3Q2MJR0 410 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 TBCELQ5QJ74 424 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 NUDT13Q86X67 352 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 OR10G3Q8NGC4 313 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 DOK4Q8TEW6 326 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 DIO2Q92813 273 aa21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 IGSF5Q9NSI5 407 aa21.47■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 NCKAP5O14513 1909 aa21.47■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 HRKO00198 91 aa21.46■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 UGDHO60701 494 aa21.46■■□□□ 1.03
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TMEM54-201ENST00000329151 FAM58BPP0C7Q3 252 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 KRT15P19012 456 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 CASQ1P31415 396 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 MASP1P48740 699 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 TRPC1P48995 793 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 NRG3P56975 720 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 GTF2H2Q13888 395 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 SETDB1Q15047 1291 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 HSPB2Q16082 182 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 MROH9Q5TGP6 573 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 RTL6Q6ICC9 239 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 ARSKQ6UWY0 536 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 SPRR3Q9UBC9 169 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 ITPR3Q14573 2671 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM54-201ENST00000329151 DVL2O14641 736 aa21.45■■□□□ 1.02
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TMEM54-201ENST00000329151 PIK3R1P27986 724 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 UQCRC1P31930 480 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 CUL3Q13618 768 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 ACAP2Q15057 778 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 TOMM20Q15388 145 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 NEIL3Q8TAT5 605 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 FBXO25Q8TCJ0 367 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 SLC6A15Q9H2J7 730 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 IPPKQ9H8X2 491 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 ACKR4Q9NPB9 350 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 SNX15Q9NRS6 342 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 H0YIV9 168 aa21.44■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 LRATO95237 230 aa21.44■■□□□ 1.02
TMEM54-201ENST00000329151 SLC35E2P0CK97 266 aa21.44■■□□□ 1.02
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