RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299194.5

LRTM2-201, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,688 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-201ENST00000299194 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 ATAT1Q5SQI0 421 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 OR2G6Q5TZ20 316 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 MTSS1LQ765P7 747 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 MFSD4AQ8N468 514 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 GATAD2BQ8WXI9 593 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 RGMAQ96B86 450 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 KLHL31Q9H511 634 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 COMMD3Q9UBI1 195 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 ATP6V1HQ9UI12 483 aa12.31□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 TRPM6Q9BX84 2022 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 AGAP5A6NIR3 686 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 DNAJB5O75953 348 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 COPZ1P61923 177 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 RBBP4Q09028 425 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 KLHL6Q8WZ60 621 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 LMLNQ96KR4 655 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 WDR26Q9H7D7 661 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 MYNNQ9NPC7 610 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 SSR3Q9UNL2 185 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 CLCA2Q9UQC9 943 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 GSAPA4D1B5 854 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 LILRB3O75022 631 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 NFATC1O95644 943 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 IMPDH2P12268 514 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 IL1RNP18510 177 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 BMPR1AP36894 532 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 MVDP53602 400 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 DCDC1P59894 354 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 CSNK2BP67870 215 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 LRRC32Q14392 662 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 SPHARQ15513 63 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 OR4K5Q8NGD3 323 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF566Q969W8 418 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 TM4SF18Q96CE8 201 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 DIRAS2Q96HU8 199 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 TTTY10Q9BZA0 68 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 DPP7Q9UHL4 492 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 MKLN1Q9UL63 735 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 CLEC4AQ9UMR7 237 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 CA5BQ9Y2D0 317 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 PGRMC2O15173 223 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 UPK1BO75841 260 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 RPN2P04844 631 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 ALOX5P09917 674 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 DDCP20711 480 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 P2RY2P41231 377 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 GHDCQ8N2G8 530 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 SLC7A13Q8TCU3 470 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 VOPP1Q96AW1 172 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 QRFPRQ96P65 431 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 C11orf49Q9H6J7 331 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 EGLN3Q9H6Z9 239 aa12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 ALPK2Q86TB3 2170 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 AQP9O43315 295 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 CLEC2LP0C7M8 214 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 IFNA8P32881 189 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 XCR1P46094 333 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 CLDN2P57739 230 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 NCF4Q15080 339 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 KLHL12Q53G59 568 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 PDZK1Q5T2W1 519 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 TMEFF1Q8IYR6 380 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 OR2L2Q8NH16 312 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 OR5P2Q8WZ92 322 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 INIPQ9NRY2 104 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 QPCTLQ9NXS2 382 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 NTNG1Q9Y2I2 539 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 WDR37Q9Y2I8 494 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 A6NL46 340 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 RCVRNP35243 200 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 RAB25P57735 213 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 BTN3A2P78410 334 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 SLC9A5Q14940 896 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 PYDC2Q56P42 97 aa12.29□□□□□ -0.44
LRTM2-201ENST00000299194 FAM78AQ5JUQ0 283 aa12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms