RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 RPS15P62841 145 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 BNIP3Q12983 259 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 GAS6Q14393 721 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PAQR7Q86WK9 346 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 IL22RA1Q8N6P7 574 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 RHBDF1Q96CC6 855 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 FZD3Q9NPG1 666 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 GLT8D1Q68CQ7 371 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 LCTLQ6UWM7 567 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 COMMD6Q7Z4G1 85 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 OR51G2Q8NGK0 314 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 C5orf51A6NDU8 294 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ARHGAP19Q14CB8 494 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CYP17A1P05093 508 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PROS1P07225 676 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ERVPABLB-1P60509 514 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SERTAD2Q14140 314 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SCO2O43819 266 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ACY1Q03154 408 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ST3GAL4Q11206 333 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 OCLNQ16625 522 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 LCN8Q6JVE9 175 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 S100A6P06703 90 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 GLP1RP43220 463 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CRISP1P54107 249 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SERINC2Q96SA4 455 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 LAPTM4AQ15012 233 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PDZD3Q86UT5 571 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 SLC22A31A6NKX4 558 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 STX12Q86Y82 276 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 MUS81Q96NY9 551 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 LPAR4Q99677 370 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SLC30A2Q9BRI3 323 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 APOOQ9BUR5 198 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ANKMY1Q9P2S6 941 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 G3V2L1 256 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 DCKP27707 260 aa22.1■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 MNTQ99583 582 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CHD4Q14839 1912 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 GXYLT2A0PJZ3 443 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CEBPBP17676 345 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 GGT1P19440 569 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 GPAT4Q86UL3 456 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 METTL25Q8N6Q8 603 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 THAP4Q8WY91 577 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 RGPD5Q99666 1765 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 GCGRP47871 477 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PHC1P78364 1004 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 MOGQ16653 247 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF283Q8N7M2 679 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 LRRC20Q8TCA0 184 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 MROQ9BYG7 248 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 RTCAO00442 366 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SLC19A2O60779 497 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 DEFB103AP81534 67 aa22.09■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 C6orf141Q5SZD1 244 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CMAHPQ9Y471 501 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 DLGAP1O14490 977 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PRAMEF2O60811 474 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 NDUFV2P19404 249 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 TTYH2Q9BSA4 534 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 WASF3Q9UPY6 502 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 A0A1W2PPL8 197 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 L7N2F9 121 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 VAMP2P63027 116 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 GK3PQ14409 553 aa22.09■■□□□ 1.13
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