RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 SMIM10Q96HG1 83 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 SERHL2Q9H4I8 314 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 C3orf14Q9HBI5 128 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 EXD2Q9NVH0 621 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC160A6NGH7 325 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 BCKDKO14874 412 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 OR6B1O95007 311 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 BMP10O95393 424 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 NR2F1P10589 423 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 ELK4P28324 431 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 YAP1P46937 504 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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RPUSD1-201ENST00000007264 DUSP2Q05923 314 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 IL18R1Q13478 541 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR19Q15760 415 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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RPUSD1-201ENST00000007264 RSC1A1Q92681 617 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 TSC22D3Q99576 134 aa22.59■■□□□ 1.21
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RPUSD1-201ENST00000007264 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC16A6O15403 523 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 JRKO75564 520 aa22.59■■□□□ 1.21
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RPUSD1-201ENST00000007264 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 ALOX12P18054 663 aa22.59■■□□□ 1.21
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RPUSD1-201ENST00000007264 AVL9Q8NBF6 648 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 RASSF5Q8WWW0 418 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 PROX1Q92786 737 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 KNL1Q8NG31 2342 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 TLR4O00206 839 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 EMC8O43402 210 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 PAX7P23759 505 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 CDH12P55289 794 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 LIM2P55344 173 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP1CAP62136 330 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNC4Q03721 635 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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RPUSD1-201ENST00000007264 CNPY1Q3B7I2 92 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHL35Q6PF15 583 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.58■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 LMX1AQ8TE12 382 aa22.58■■□□□ 1.21
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RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1W2PS29 197 aa22.58■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM64A6NGJ6 449 aa22.58■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 MANEAQ5SRI9 462 aa22.58■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.58■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 GIPC3Q8TF64 312 aa22.58■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF681Q96N22 645 aa22.58■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 SEC14L3Q9UDX4 400 aa22.58■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 SPACA6W5XKT8 324 aa22.58■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA6CQ9H3T2 930 aa22.57■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.57■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 PRAMEF25A6NGN4 478 aa22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 FESP07332 822 aa22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 CDH3P22223 829 aa22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS6KA3P51812 740 aa22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 CRISP3P54108 245 aa22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 ESRRGP62508 458 aa22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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