RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	UBE3A	Q05086	875 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PDGFRL	Q15198	375 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	LACC1	Q8IV20	430 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DACH2	Q96NX9	599 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	WDR26	Q9H7D7	661 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	F5	P12259	2224 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF24	P17028	368 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	GRK3	P35626	688 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KRT33B	Q14525	404 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OXA1L	Q15070	435 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RGMA	Q96B86	450 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CENPO	Q9BU64	300 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	HDAC8	Q9BY41	377 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL31	Q9H511	634 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KRBA1	A5PL33	1030 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA3D	O95025	777 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KAT7	O95251	611 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CA3	P07451	260 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CD72	P21854	359 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	GJA4	P35212	333 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CSNK1G2	P78368	415 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	AGBL4	Q5VU57	503 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DPH7	Q9BTV6	452 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PELI2	Q9HAT8	420 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152		M0R3H8	397 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ERG	P11308	486 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RAB15	P59190	212 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	REEP5	Q00765	189 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF404	Q494X3	552 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DCST1	Q5T197	706 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MLIP	Q5VWP3	458 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	GANC	Q8TET4	914 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152		Q96MT0	163 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	NEURL2	Q9BR09	285 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MRO	Q9BYG7	248 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DPP7	Q9UHL4	492 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZAR1L	A6NP61	321 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KMO	O15229	486 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZW10	O43264	779 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	NR2F1	P10589	423 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SOX9	P48436	509 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RGS6	P49758	472 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DOC2B	Q14184	412 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	IRF4	Q15306	451 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CST6	Q15828	149 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	COMTD1	Q86VU5	262 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RAB7B	Q96AH8	199 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		12.4	□□□□□ -0.42

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