RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PAGE2BQ5JRK9 111 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 AMER3Q8N944 861 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2E3Q969T4 207 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 REPS1Q96D71 796 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM8Q9BZR9 551 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 AIG1Q9NVV5 245 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 NF1P21359 2839 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 IDSB3KWA1 339 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 GYG2O15488 501 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX11AO75192 247 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 BMP10O95393 424 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 WDPCPO95876 746 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 FBLP22087 321 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGER4P35408 488 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
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CAPNS1-216ENST00000628306 PCOLCEQ15113 449 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 MIER2Q8N344 545 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR20Q8TBZ3 569 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SELENOMQ8WWX9 145 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 BRF2Q9HAW0 419 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PPT2Q9UMR5 302 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGAMP11215 1152 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR1EP28566 365 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 EMP2P54851 167 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 DSG2Q14126 1118 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MUM1Q2TAK8 710 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 AP5B1Q2VPB7 878 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 LAS2Q8IYD9 372 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM9CQ8IZT9 166 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC5A11Q8WWX8 675 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 NEIL2Q969S2 332 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF32Q9H0A6 362 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ZIM2Q9NZV7 527 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 H0YGG7 62 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 GSC2O15499 205 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 CD22P20273 847 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 EMP3P54852 163 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ADORA2A-AS1P86434 159 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS6KA2Q15349 733 aa22.63■■□□□ 1.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.63■■□□□ 1.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.63■■□□□ 1.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD11Q8NFV4 315 aa22.63■■□□□ 1.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 NT5DC2Q9H857 520 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PELI2Q9HAT8 420 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf109Q9NX04 203 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 NDE1Q9NXR1 346 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 FOXS1O43638 330 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT34O76011 436 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 COQ5Q5HYK3 327 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 FAAH2Q6GMR7 532 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 FNDC5Q8NAU1 212 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 IMMP1LQ96LU5 166 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 DPH7Q9BTV6 452 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TGIF2Q9GZN2 237 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 LRTM1Q9HBL6 345 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.62■■□□□ 1.21
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