RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ARID1AO14497 2285 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 INPPL1O15357 1258 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 IFNW1P05000 195 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CSF3P09919 207 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 HNF1BP35680 557 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SPAM1P38567 509 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 DDOSTP39656 456 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 HBA1P69905 142 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CHRNEQ04844 493 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 EFR3AQ14156 821 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 DUSP7Q16829 419 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SAMD11Q96NU1 681 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 WACQ9BTA9 647 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RNF121Q9H920 327 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FNIP2Q9P278 1114 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 V9GYH0 126 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 C2orf78A6NCI8 922 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 A8MUA0 341 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PGRMC2O15173 223 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 UGT2B17O75795 530 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TGFB1P01137 390 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 HLA-DQA2P01906 255 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ANXA8P13928 327 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 C4BPBP20851 252 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PRKACBP22694 351 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CTGFP29279 349 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 WASP42768 502 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TAS2R41P59536 307 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.353e-7■■□□□ 13
NEDD9-216ENST00000620854 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FAPQ12884 760 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SCARB2Q14108 478 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LRRC32Q14392 662 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 INSL4Q14641 139 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 P2RY14Q15391 338 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 IFI44LQ53G44 452 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CHST9Q7L1S5 443 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PARGQ86W56 976 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 COMMD2Q86X83 199 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR8H3Q8N146 312 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GPR26Q8NDV2 337 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 MYLIPQ8WY64 445 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RAB8BQ92930 207 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 QRFPRQ96P65 431 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CCDC32Q9BV29 185 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TDP1Q9NUW8 608 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CMAHPQ9Y471 501 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 E7EQ34 232 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SCN2BO60939 215 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 F11P03951 625 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 HBQ1P09105 142 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NAT1P18440 290 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PTGER1P34995 402 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 HYAL2Q12891 473 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LHX8Q68G74 356 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SCAMP4Q969E2 229 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF607Q96SK3 696 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 EPYCQ99645 322 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SRRQ9GZT4 340 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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