RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 VASNQ6EMK4 673 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SPESP1Q6UW49 350 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NAPRTQ6XQN6 538 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 LUZP2Q86TE4 346 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TNS4Q8IZW8 715 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RDH11Q8TC12 318 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PHF21BQ96EK2 531 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GCNAQ96QF7 691 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MND1Q9BWT6 205 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TASP1Q9H6P5 420 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PNPOQ9NVS9 261 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 A0A1W2PRB8 838 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 B2RBV5 119 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SUV39H1O43463 412 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PDE9AO76083 593 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 IFNA6P05013 189 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RHOQP17081 205 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PEX2P28328 305 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SP3Q02447 781 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ANGPT1Q15389 498 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RNLSQ5VYX0 342 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GPR149Q86SP6 731 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SVOPLQ8N434 492 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 KYQ8NBH2 561 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 FICDQ9BVA6 458 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MED17Q9NVC6 651 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 OXSMQ9NWU1 459 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 H7C2Y5 167 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TRIM13O60858 407 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 VNN2O95498 520 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 IGLV3-27P01718 113 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 GRK4P32298 578 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 CPOXP36551 454 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PRKAA2P54646 552 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 RGS1Q08116 209 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 STX4Q12846 297 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TSPAN31Q12999 210 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 BEX5Q5H9J7 111 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 EPGNQ6UW88 154 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 RRM2BQ7LG56 351 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TEX26Q8N6G2 289 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TADA1Q96BN2 335 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 R3HDM4Q96D70 268 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TMEM74Q96NL1 305 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PKP2Q99959 881 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PRR14Q9BWN1 585 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TOR3AQ9H497 397 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 EQTNQ9NQ60 294 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 POLE4Q9NR33 117 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 AP4S1Q9Y587 144 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms