RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC37A1P57057 533 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CLDN2P57739 230 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 REEP5Q00765 189 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PAX5Q02548 391 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CHRNB3Q05901 458 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SULT2A1Q06520 285 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IL10RBQ08334 325 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DMWDQ09019 674 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 STX3Q13277 289 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PMS2P3Q13401 168 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KEAP1Q14145 624 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GCKRQ14397 625 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 P2RY14Q15391 338 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TPSAB1Q15661 275 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ALX1Q15699 326 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PSG3Q16557 428 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RBBP7Q16576 425 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 STX1AQ16623 288 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 BMT2Q1RMZ1 405 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ODF4Q2M2E3 257 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ALKBH6Q3KRA9 238 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SBK1Q52WX2 424 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 AGKQ53H12 422 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 XKR4Q5GH76 650 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CDKL4Q5MAI5 379 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C6orf183Q5T699 404 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 H3F3CQ6NXT2 135 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD16Q6P6B7 361 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM220Q6QAJ8 160 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FIGLAQ6QHK4 219 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 VSTM1Q6UX27 236 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM151BQ6UXP7 276 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PAGE2Q7Z2X7 111 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM122BQ7Z309 247 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LONP2Q86WA8 852 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC26A11Q86WA9 606 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 VRK3Q8IV63 474 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LAS2Q8IYD9 372 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGAP18Q8N392 663 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR51L1Q8NGJ5 315 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF398Q8TD17 642 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ESR2Q92731 530 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TFAP2CQ92754 450 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ECHDC3Q96DC8 303 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ASB9Q96DX5 294 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HPDLQ96IR7 371 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZFYVE19Q96K21 471 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EGLN2Q96KS0 407 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FRG2BQ96QU4 278 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ACOX2Q99424 681 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RTP3Q9BQQ7 232 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HINT2Q9BX68 163 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TEKT3Q9BXF9 490 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TKTL2Q9H0I9 626 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MARCH7Q9H992 704 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MCCC2Q9HCC0 563 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 POLD4Q9HCU8 107 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LYRM4Q9HD34 91 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NDE1Q9NXR1 346 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NLKQ9UBE8 527 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DCDC2Q9UHG0 476 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NAGKQ9UJ70 344 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB23Q9ULC3 237 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.9 ms