RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 OR1C1Q15619 314 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SPINK14Q6IE38 97 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ATCAYQ86WG3 371 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SIRT5Q9NXA8 310 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 MAP10Q9P2G4 905 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 C1orf226A1L170 272 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 HRKO00198 91 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 NPHS1O60500 1241 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 VPS4BO75351 444 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CRCPO75575 148 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 IGKV3-11P04433 115 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SLC35E2P0CK97 266 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 BTKQ06187 659 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ACSM2AQ08AH3 577 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SPIN4Q56A73 249 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ZNF766Q5HY98 468 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ACSM2BQ68CK6 577 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CLEC6AQ6EIG7 209 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 HSDL2Q6YN16 418 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 TRIM46Q7Z4K8 759 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CROCCP2Q86T23 111 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 MMP21Q8N119 569 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 OR8K3Q8NH51 312 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SUN3Q8TAQ9 357 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 GRHL3Q8TE85 626 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 DOK4Q8TEW6 326 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 TAAR6Q96RI8 345 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 VPS4AQ9UN37 437 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 TCP11X1B4DZS4 312 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 AZIN1O14977 448 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 NEURL1O76050 574 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CHRNGP07510 517 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 BPGMP07738 259 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 PIK3R1P27986 724 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 GALNSP34059 522 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 HLCSP50747 726 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 RNF4P78317 190 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SPRED3Q2MJR0 410 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ZNF750Q32MQ0 723 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SLC48A1Q6P1K1 146 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 GALNT18Q6P9A2 607 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ZNF227Q86WZ6 799 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 OR4K14Q8NGD5 310 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 OR6Y1Q8NGX8 325 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 PGM2Q96G03 612 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SCMH1Q96GD3 660 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CENPHQ9H3R5 247 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CLMPQ9H6B4 373 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 LRFN1Q9P244 771 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CCL27Q9Y4X3 112 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 FCHO1O14526 889 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 PCDH7O60245 1069 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 OR10H2O60403 315 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ITGA10O75578 1167 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CPMP14384 443 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 GNLYP22749 145 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.716e-28■■□□□ 12.8
ACTB-211ENST00000480301 ARRB2P32121 409 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 UQCRFS1P47985 274 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CYB561P49447 251 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 XKP51811 444 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 INAQ16352 499 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 FAR1Q8WVX9 515 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 RIT1Q92963 219 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 FBXL20Q96IG2 436 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 HES7Q9BYE0 225 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 MYOTQ9UBF9 498 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 HEY2Q9UBP5 337 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ACTL7BQ9Y614 415 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 DYRK3O43781 588 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 CBX6O95503 412 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 FGF4P08620 206 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 IL3P08700 152 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 HK2P52789 917 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 MPP2Q14168 576 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 IMPG1Q17R60 797 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 SPDYAQ5MJ70 313 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 KANK2Q63ZY3 851 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 C16orf78Q8WTQ4 265 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 ART5Q96L15 291 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 CNPPD1Q9BV87 410 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 FAIM2Q9BWQ8 316 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 EBPLQ9BY08 206 aa19.45■□□□□ 0.7
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