RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475978.1

SH3BP5L-202, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 4,122 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-202ENST00000475978 SLC38A2Q96QD8 506 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 PIP5K1AQ99755 562 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 REV1Q9UBZ9 1251 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 SLC28A2O43868 658 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 AVPR1BP47901 424 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 RGNQ15493 299 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 GPR33Q49SQ1 333 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 SPRYD7Q5W111 196 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 OLFML2AQ68BL7 652 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 CNIH2Q6PI25 160 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 SSX6Q7RTT6 188 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 PDZD9Q8IXQ8 264 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 NXPE1Q8N323 547 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 AP2M1Q96CW1 435 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 CACNG6Q9BXT2 260 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 SIRT5Q9NXA8 310 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 NDUFAF4Q9P032 175 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 PRSS21Q9Y6M0 314 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A0U1RQF3 1178 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR6C75A6NL08 312 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 CYP17A1P05093 508 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 RFX3P48380 749 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ARHGDIBP52566 201 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ERVK-21P61565 698 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF33BQ06732 778 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 RGS1Q08116 209 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 GBX1Q14549 363 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 SLC25A25Q6KCM7 469 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 TRIM46Q7Z4K8 759 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 SYNPOQ8N3V7 929 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A1B0GVC2 190 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 SH3D21A4FU49 640 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 A6NIN4 97 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 PDCD5O14737 125 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 DSCR3O14972 297 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 NR2F1P10589 423 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ALAS2P22557 587 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 RPS19P39019 145 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 MANFP55145 182 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 SLC14A1Q13336 389 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZMAT1Q5H9K5 638 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 LRIF1Q5T3J3 769 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 LIMS2Q7Z4I7 341 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF280BQ86YH2 543 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 FCRL4Q96PJ5 515 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 C3orf14Q9HBI5 128 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 WASH6PQ9NQA3 447 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 RLIMQ9NVW2 624 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 PPT2Q9UMR5 302 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM5Q9Y2B1 443 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A1W2PPL8 197 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 J3KTA2 159 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 INPPL1O15357 1258 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 PRMT3O60678 531 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ENTPD6O75354 484 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 PRG2P13727 222 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF250P15622 560 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 CFL1P23528 166 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 APEX1P27695 318 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 RPL3P39023 403 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 PPP3R1P63098 170 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ARF5P84085 180 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 GRIN2CQ14957 1233 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 FCN2Q15485 313 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 CCL14Q16627 93 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 RAB12Q6IQ22 244 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 RGMBQ6NW40 437 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 MED16Q9Y2X0 877 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 PCDH17O14917 1159 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ARSBP15848 533 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 AMD1P17707 334 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 MAPK8P45983 427 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 IHHQ14623 411 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 GRK1Q15835 563 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 OTOP2Q7RTS6 562 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 SAMD12Q8N8I0 201 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR52E4Q8NGH9 312 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 XAGE5Q8WWM1 108 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 NELL2Q99435 816 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 SCN4AP35499 1836 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 TRAV20A0A0B4J274 112 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A1W2PRB8 838 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms