RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 ADCK2Q7Z695 626 aa17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 CLIP4Q8N3C7 705 aa17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 PARP16Q8N5Y8 322 aa17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SUSD6Q92537 303 aa17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 NDUFS4O43181 175 aa17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 AQP9O43315 295 aa17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SERPIND1P05546 499 aa17.38■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 XKP51811 444 aa17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SMIM11AP58511 58 aa17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 CDK3Q00526 305 aa17.38■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 CDC20Q12834 499 aa17.38■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 CCDC88CQ9P219 2028 aa17.38■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGAP33O14559 1287 aa17.37■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 KCNJ5P48544 419 aa17.37■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 SFTPA1Q8IWL2 248 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 RAB42Q8N4Z0 105 aa17.37■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 RAB7BQ96AH8 199 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 NUAK2Q9H093 628 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM245Q9H330 911 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 REV1Q9UBZ9 1251 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SEMA7AO75326 666 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 ADRA2AP08913 450 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 ALOX12P18054 663 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 PPP2R1BP30154 601 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SLC15A1P46059 708 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 LIMK1P53667 647 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 FAM46CQ5VWP2 391 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 XAGE5Q8WWM1 108 aa17.37■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 KLHL25Q9H0H3 589 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 LHX9Q9NQ69 397 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 INIPQ9NRY2 104 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa17.37■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 TBC1D3BA6NDS4 549 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 B4GALT2O60909 372 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 EPHX1P07099 455 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 OR12D1P0DN82 309 aa17.36■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 KRT73Q86Y46 540 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SLC34A3Q8N130 599 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 TRPC4Q9UBN4 977 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 MKLN1Q9UL63 735 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SNX11Q9Y5W9 270 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0G2JN53 185 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 IGLON5A6NGN9 336 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 NR2F1P10589 423 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
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SYNE4-204ENST00000465425 SSR2P43308 183 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SYPL1Q16563 259 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 MEDAGQ5VYS4 303 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SLX4IPQ5VYV7 408 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 ATCAYQ86WG3 371 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 CACUL1Q86Y37 369 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SLC35G5Q96KT7 338 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 CEP19Q96LK0 163 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 HDAC8Q9BY41 377 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A19Q9HC21 320 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 ANKMY1Q9P2S6 941 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 DPP7Q9UHL4 492 aa17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 CHD7Q9P2D1 2997 aa17.35■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 NME6O75414 186 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SYNE4-204ENST00000465425 DNTTP04053 509 aa17.35■□□□□ 0.37
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