RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 C1QCP02747 245 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 NTSP30990 170 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 XKP51811 444 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 MAPK10P53779 464 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 MLC1Q15049 377 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 ZNF621Q6ZSS3 439 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 ZNF595Q8IYB9 648 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 LANCL2Q9NS86 450 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 GPR75O95800 540 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 PTGER1P34995 402 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 PGM1P36871 562 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.243e-8■■■□□ 18.4
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NME4-209ENST00000460297 BTG2P78543 158 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 HSPB3Q12988 150 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 GAB1Q13480 694 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 RABL3Q5HYI8 236 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 CEACAM20Q6UY09 585 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 MED25Q71SY5 747 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 OR1F2PQ96R84 312 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 PISDQ9UG56 409 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 PACSIN3Q9UKS6 424 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 BLACEA4D250 179 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 TGFBR3LH3BV60 316 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 PLD2O14939 933 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 BMP10O95393 424 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 JMJD7P0C870 316 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 ZCCHC18P0CG32 403 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 RAB15P59190 212 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 SELPLGQ14242 412 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 RUNDC3AQ59EK9 446 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 DCAF12Q5T6F0 453 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 TMEM125Q96AQ2 219 aa22.77■■□□□ 1.24
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NME4-209ENST00000460297 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 CMTM6Q9NX76 183 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.77■■□□□ 1.24
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NME4-209ENST00000460297 CTSFQ9UBX1 484 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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NME4-209ENST00000460297 ONECUT2O95948 504 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 CPMP14384 443 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 MPIP34949 423 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 CDK9P50750 372 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
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NME4-209ENST00000460297 DCDP81605 110 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 SLC13A2Q13183 592 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 VWA2Q5GFL6 755 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 TAAR9Q96RI9 348 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
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NME4-209ENST00000460297 PTPRBP23467 1997 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-209ENST00000460297 MEN1O00255 615 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 CLDN4O14493 209 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 LCN10Q6JVE6 187 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 ZFP28Q8NHY6 868 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 ADA2Q9NZK5 511 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 IL10P22301 178 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 HSD17B7P56937 341 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 CEACAM7Q14002 265 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-209ENST00000460297 PIGGQ5H8A4 983 aa22.75■■□□□ 1.23
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