RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 TRPV3Q8NET8 790 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RDH11Q8TC12 318 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF721Q8TF20 911 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CCT6BQ92526 530 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PEX13Q92968 403 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 C1orf159Q96HA4 380 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RILPQ96NA2 401 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CSF3RQ99062 836 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HAUS8Q9BT25 410 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 AICDAQ9GZX7 198 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM160Q9NX00 188 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PDE10AQ9Y233 779 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CR1P17927 2039 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 USF3Q68DE3 2245 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ABCA1O95477 2261 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FRG2CA6NGY1 282 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OVOL3O00110 214 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HRKO00198 91 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TP53I11O14683 189 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CLOCKO15516 846 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 KIAA0513O60268 411 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 THBDP07204 575 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SERPINA6P08185 405 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FBXO45P0C2W1 286 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CPN1P15169 458 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CCND1P24385 295 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 AHRP35869 848 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CETN2P41208 172 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PLA2G16P53816 162 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FBXW4P57775 412 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 GPS1Q13098 491 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TBCELQ5QJ74 424 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PALM2Q8IXS6 379 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SLC15A4Q8N697 577 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 C3orf56Q8N813 242 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NUBPLQ8TB37 319 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 REPS1Q96D71 796 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MFSD3Q96ES6 412 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC42Q96M95 316 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OR4K3Q96R72 315 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CHP1Q99653 195 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 GPR21Q99679 349 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NTMT1Q9BV86 223 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 UBQLN3Q9H347 655 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TREX1Q9NSU2 369 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 A0A0G2JK05 382 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PP18 115 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CTAGE9A4FU28 777 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PLOD2O00469 737 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CYR61O00622 381 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TCF21O43680 179 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SNX4O95219 450 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 IFNB1P01574 187 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 APRTP07741 180 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 COX7A2P14406 83 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ITGA2P17301 1181 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HIST1H2ADP20671 130 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CHMP24386 653 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 IGFBP5P24593 272 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ARNTP27540 789 aa6.5□□□□□ -1.37
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