RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	ARRB2	P32121	409 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	XKR7	Q5GH72	579 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZS92	163 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	MYNN	Q9NPC7	610 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	KLF11	O14901	512 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PGRMC2	O15173	223 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	OR10H2	O60403	315 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SEC22B	O75396	215 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ATP1B1	P05026	303 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CELA2A	P08217	269 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CPM	P14384	443 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TNNI3	P19429	210 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLC1A6	P48664	564 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	STX3	Q13277	289 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TLR1	Q15399	786 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SMU1	Q2TAY7	513 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ACER2	Q5QJU3	275 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ATG16L1	Q676U5	607 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A19	Q695T7	634 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZSR9	355 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	NCLN	Q969V3	563 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	FBXL20	Q96IG2	436 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	THAP1	Q9NVV9	213 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	STMN3	Q9NZ72	180 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	GLOD5	A6NK44	160 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	OR6C76	A6NM76	312 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241		A8MUA0	341 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	FCHO1	O14526	889 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PIP5K1B	O14986	540 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZFAND5	O76080	213 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	DDAH2	O95865	285 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV3-11	P04433	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00032	P0C843	101 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PCSK2	P16519	638 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	DDC	P20711	480 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	BGN	P21810	368 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MAPK1	P28482	360 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	XK	P51811	444 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MLF1	P58340	268 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ARG2	P78540	354 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	BTK	Q06187	659 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	NR6A1	Q15406	480 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CEBPE	Q15744	281 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	INA	Q16352	499 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	HSDL2	Q6YN16	418 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	NUBPL	Q8TB37	319 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF721	Q8TF20	911 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	RIT1	Q92963	219 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ARL8A	Q96BM9	186 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ERP27	Q96DN0	273 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	BSN	Q9UPA5	3926 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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