RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF367Q7RTV3 350 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXJ1Q92949 421 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MYRFLQ96LU7 910 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MUSKO15146 869 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2B3O76000 313 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SEMA4FO95754 770 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 OXTRP30559 389 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP2K4P45985 399 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM17Q86X19 198 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 OR7G3Q8NG95 312 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DOK4Q8TEW6 326 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC107Q8WV48 283 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 NSMAFQ92636 917 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MR1Q95460 341 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 KLF15Q9UIH9 416 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 UNC119BA6NIH7 251 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SOCS2O14508 198 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CLCN2P51788 898 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TMBIM6P55061 237 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM118AQ9NWS6 357 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CDH10Q9Y6N8 788 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CITO14578 2027 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SOX30O94993 753 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 OR56A3Q8NH54 315 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP76Q8TAP6 659 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM19Q96HH6 336 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF38Q9H0F5 515 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GJD2Q9UKL4 321 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CKMT1AP12532 417 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GADD45AP24522 165 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GCGRP47871 477 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PMS2P3Q13401 168 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GTDC1Q4AE62 458 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF111Q6ZNA4 994 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF227Q86WZ6 799 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DKKL1Q9UK85 242 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 UGDHO60701 494 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 APOL3O95236 402 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 AK1P00568 194 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 IL1RNP18510 177 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HTRA3P83110 453 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 OR14I1A6ND48 311 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CSTBP04080 98 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CEBPBP17676 345 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FBLP22087 321 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GDI2P50395 445 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 RMI1Q9H9A7 625 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PELI2Q9HAT8 420 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SMOXQ9NWM0 555 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CMAHPQ9Y471 501 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 WASHC1A8K0Z3 465 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 WASH3PC4AMC7 463 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 C11orf98E9PRG8 122 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SCO2O43819 266 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ARSAP15289 507 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM189BP81408 668 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PLCXD2Q0VAA5 305 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF234Q14588 700 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CLCA4Q14CN2 919 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM189A2Q15884 450 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PPM1BO75688 479 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MT-ND2P03891 347 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 JMJD7P0C870 316 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 S100A1P23297 94 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FEVQ99581 238 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DPAGT1Q9H3H5 408 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HCSTQ9UBK5 93 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms