RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414409.1

AC005999.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC005999.1, Length 588 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005999.1-201ENST00000414409 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.81□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.81□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 PHF11Q9UIL8 331 aa7.81□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.81□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 CACNA1CQ13936 2221 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ZFHX3Q15911 3703 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 OR6C76A6NM76 312 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 TAPBPO15533 448 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 FGF17O60258 216 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 SNX4O95219 450 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 C1QAP02745 245 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 RAF1P04049 648 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 IGKV3-11P04433 115 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 FBXO45P0C2W1 286 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 CCDC166P0CW27 439 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 EPXP11678 715 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 PCNAP12004 261 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 GDF1P27539 372 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 HSPA7P48741 367 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 RAP1GDS1P52306 607 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ARFIP1P53367 373 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 DR1Q01658 176 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ID2Q02363 134 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 GTF3C1Q12789 2109 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 SLAMF1Q13291 335 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ZNF793Q6ZN11 406 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 BIVMQ86UB2 503 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 GPR180Q86V85 440 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 FAM13CQ8NE31 585 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 DIO2Q92813 273 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 RGMAQ96B86 450 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ZNF597Q96LX8 424 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 SH3GL2Q99962 352 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 CD244Q9BZW8 370 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 LIME1Q9H400 295 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 WDR41Q9HAD4 459 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 RNF112Q9ULX5 631 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 SNX12Q9UMY4 172 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 PSAT1Q9Y617 370 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 MED13LQ71F56 2210 aa7.8□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 OR10H2O60403 315 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 PRAMEF4O60810 478 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 CDH16O75309 829 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 TRAPPC6AO75865 159 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 GPR75O95800 540 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 TGFB1P01137 390 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 CD1DP15813 335 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 STMN1P16949 149 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 TACR1P25103 407 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 GALNSP34059 522 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 OPRM1P35372 400 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 GCKP35557 465 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 MASP1P48740 699 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 TRPC1P48995 793 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ADAM8P78325 824 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 PHEXP78562 749 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 SORDQ00796 357 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 DUSP8Q13202 625 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 E2F2Q14209 437 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 NTRK2Q16620 822 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.79□□□□□ -1.16
AC005999.1-201ENST00000414409 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms