RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.07□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ASB8Q9H765 288 aa6.07□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.07□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 IL17CQ9P0M4 197 aa6.07□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 A0A0U1RQS6 177 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 HEATR9A2RTY3 570 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 D6RAR5 112 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 AHCYL1O43865 530 aa6.06□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.06□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 KRT33BQ14525 404 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 AMZ1Q400G9 498 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 KLHL35Q6PF15 583 aa6.06□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 GPAT4Q86UL3 456 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 AMZ2Q86W34 360 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 PELI3Q8N2H9 469 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.06□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 RTP4Q96DX8 246 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SMIM14Q96QK8 99 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 APOL2Q9BQE5 337 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SMOXQ9NWM0 555 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 PTPRBP23467 1997 aa6.06□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 LRP4O75096 1905 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 MASP2O00187 686 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CHUKO15111 745 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 HLA-DQA2P01906 255 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 APRTP07741 180 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 FMO4P31512 558 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ADRA1AP35348 466 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 CHRNA6Q15825 494 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SNX20Q7Z614 316 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.05□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 COPS8Q99627 209 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.05□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.05□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 ARL5AQ9Y689 179 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 U3KQA8 63 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 MAP2K7O14733 419 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 AMD1P17707 334 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CCKBRP32239 447 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CPA2P48052 419 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SLC12A2P55011 1212 aa6.05□□□□□ -1.44
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