RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 A0A0J9YVX5 310 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1W2PR48 441 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 KRBA1A5PL33 1030 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 C4orf51C9J302 202 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 hCG_2039718K7EN88 272 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 PPM1DO15297 605 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ST8SIA5O15466 376 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 PROM1O43490 865 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 C9P02748 559 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 STATHP02808 62 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 CSF2P04141 144 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 FHP07954 510 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 LINGO3P0C6S8 592 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 IGFBP5P24593 272 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 CDK9P50750 372 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 NR1H2P55055 460 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 BTN3A2P78410 334 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TNFRSF17Q02223 184 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 FZD5Q13467 585 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 CEBPEQ15744 281 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 FCRL6Q6DN72 434 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SZRD1Q7Z422 152 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 GALNT10Q86SR1 603 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TRIM73Q86UV7 250 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF786Q8N393 782 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 AMER3Q8N944 861 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 PATE1Q8WXA2 126 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 FBXL20Q96IG2 436 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF607Q96SK3 696 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 IER2Q9BTL4 223 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ING2Q9H160 280 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 EPB41L1Q9H4G0 881 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 UCK1Q9HA47 277 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 PILRAQ9UKJ1 303 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ATG4BQ9Y4P1 393 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 U3KQV3 271 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 XIRP2A4UGR9 3374 aa10.53□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 A0A087WXM4 84 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 B4DGG1 531 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 M0QX08 132 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SERPINB7O75635 380 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 AVPP01185 164 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 BCHEP06276 602 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 GNAO1P09471 354 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ITGAMP11215 1152 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CPN2P22792 545 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 FASLGP48023 281 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CRYBA2P53672 197 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 IST1P53990 364 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CASP9P55211 416 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SKP1P63208 163 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF542PQ5EBM4 170 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 FAM180BQ6P0A1 224 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 FBXO42Q6P3S6 717 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SIX5Q8N196 739 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 HORMAD2Q8N7B1 307 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 KCT2Q8NC54 265 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SETD9Q8NE22 299 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PRR7Q8TB68 274 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TAMM41Q96BW9 452 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 C7orf34Q96L11 122 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 MACROD1Q9BQ69 325 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC3Q9BQI4 270 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 FOXQ1Q9C009 403 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TOR3AQ9H497 397 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 C3orf14Q9HBI5 128 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 C2orf42Q9NWW7 574 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 POMT2Q9UKY4 750 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 BLOC1S6Q9UL45 172 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM131Q92545 1883 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC88CQ9P219 2028 aa10.52□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 LILRA5A6NI73 299 aa10.51□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TLR4O00206 839 aa10.51□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PLOD2O00469 737 aa10.51□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 HMGN4O00479 90 aa10.51□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 EMC8O43402 210 aa10.51□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CTSVO60911 334 aa10.51□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 UGT2B11O75310 529 aa10.51□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms