RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ING4Q9UNL4 249 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SHISA3A0PJX4 238 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SNTNA6NMZ2 147 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 B4DXG7 233 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 AQP7O14520 342 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CTDSP2O14595 271 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FPGTO14772 594 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 INSIG1O15503 277 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SLC43A1O75387 559 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 STK16O75716 305 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CXCL14O95715 111 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CKMP06732 381 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA5P08758 320 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00271P0C7V0 271 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ENGP17813 658 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GABRB1P18505 474 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C4BPBP20851 252 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP24386 653 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PTPN6P29350 595 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 OR1E1P30953 314 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TGFBR1P36897 503 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9A3P48764 834 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HNMTP50135 292 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 KCNQ1P51787 676 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SCAND1P57086 179 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TAF10Q12962 218 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 EFR3AQ14156 821 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GPR19Q15760 415 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 IFI44LQ53G44 452 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SCD5Q86SK9 330 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RBFAQ8N0V3 343 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PGBD5Q8N414 524 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C7orf34Q96L11 122 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SLC32A1Q9H598 525 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GPR83Q9NYM4 423 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 YIPF1Q9Y548 306 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01553A4QN01 128 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00862A6NCI5 91 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM12O43184 909 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 UGDHO60701 494 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SCN2BO60939 215 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TIAF1O95411 115 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 VNN2O95498 520 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN19P0C672 248 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GAAP10253 952 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF30P17039 623 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CTRB1P17538 263 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ATF6P18850 670 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA7P48741 367 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 INPP1P49441 399 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RABGGTBP53611 331 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MAPK12P53778 367 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 BTG1P62324 171 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SELENOWP63302 87 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RNF4P78317 190 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CD83Q01151 205 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SLAMF1Q13291 335 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RIN1Q13671 783 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SPHARQ15513 63 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FDX2Q6P4F2 183 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.85□□□□□ -1.31
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