RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 MYO7AQ13402 2215 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PRRT4C9JH25 899 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 H7BY64 318 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HMGN4O00479 90 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PDPK1O15530 556 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LATO43561 262 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SLC28A2O43868 658 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PRKYO43930 277 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TMPRSS11DO60235 418 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 COQ9O75208 318 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 IFNA14P01570 189 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CYP17A1P05093 508 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HBQ1P09105 142 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 OSMP13725 252 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DDCP20711 480 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PTNP21246 168 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ACADLP28330 430 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TNFSF8P32971 234 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SOX6P35712 828 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 BMPR1AP36894 532 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SLC15A1P46059 708 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 GJA8P48165 433 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DGKGP49619 791 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HMGA2P52926 109 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 OLR1P78380 273 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF45Q02386 682 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF91Q05481 1191 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DHCR24Q15392 516 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TAB1Q15750 504 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SHFQ7M4L6 423 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ASB15Q8WXK1 588 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM203Q969S6 136 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PDXPQ96GD0 296 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CRELD1Q96HD1 420 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LHX9Q9NQ69 397 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 KCND3Q9UK17 655 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 USP34Q70CQ2 3546 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 NOTCH4Q99466 2003 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 LTBP2Q14767 1821 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 COL4A3Q01955 1670 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PS29 197 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 SCAMP1O15126 338 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ASNA1O43681 348 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PAPLNO95428 1278 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PTTG1O95997 202 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PCCBP05166 539 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 CISD3P0C7P0 127 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00271P0C7V0 271 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 CCL5P13501 91 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 EPCAMP16422 314 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 BSGP35613 385 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 VIPR2P41587 438 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 XKP51811 444 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 PRKAG1P54619 331 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TEKQ02763 1124 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 BAK1Q16611 211 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 DCST1Q5T197 706 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 FAM129CQ86XR2 697 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 SCAIQ8N9R8 606 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-202ENST00000342084 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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