RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 OR2T33Q8NG76 320 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF773Q6PK81 442 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 MROQ9BYG7 248 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 EXTL2Q9UBQ6 330 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 RAD51DO75771 328 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 RNH1P13489 461 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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