RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF793Q6ZN11 406 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 USP43Q70EL4 1123 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 OR2A1Q8NGT9 310 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 UCN3Q969E3 161 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 WFDC6Q9BQY6 131 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 SARGQ9BW04 601 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 PRM3Q9NNZ6 103 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 C5AR2Q9P296 337 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 RHCGQ9UBD6 479 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 DUSP12Q9UNI6 340 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 EFCAB10A6NFE3 127 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 FAM227AF5H4B4 570 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 OSMP13725 252 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 MYOGP15173 224 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 PKLRP30613 574 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 GJA4P35212 333 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 MAGEA8P43361 318 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 IRF4Q15306 451 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 SLX4IPQ5VYV7 408 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 OR4C11Q6IEV9 310 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 COMTD1Q86VU5 262 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 NLGN4XQ8N0W4 816 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 RASSF5Q8WWW0 418 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 TIMM29Q9BSF4 260 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 ZSCAN32Q9NX65 697 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 MGAT4BQ9UQ53 548 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 LRIT2A6NDA9 550 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 FAAHO00519 579 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 SLC35G4P0C7Q5 338 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 DRD2P14416 443 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 POU2F1P14859 743 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 CNR2P34972 360 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 RGS6P49758 472 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 CLCNKAP51800 687 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 PPP5CP53041 499 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 ARFIP1P53367 373 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 HSPB3Q12988 150 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF404Q494X3 552 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 ATCAYQ86WG3 371 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 LACC1Q8IV20 430 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 FAM46DQ8NEK8 389 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 GDE1Q9NZC3 331 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 COL4A2P08572 1712 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 C4orf51C9J302 202 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 MID1O15344 667 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 EPPINO95925 133 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 CRISP3P54108 245 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 OLR1P78380 273 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 RNLSQ5VYX0 342 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM64Q6YI46 380 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 PLD3Q8IV08 490 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 OR2L8Q8NGY9 312 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 FGF11Q92914 225 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 AMDHD1Q96NU7 426 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 CDADC1Q9BWV3 514 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 GLIPR2Q9H4G4 154 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 SFXN1Q9H9B4 322 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 SERGEFQ9UGK8 458 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 DAPK2Q9UIK4 370 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 A4GNTQ9UNA3 340 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 IFT52Q9Y366 437 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 ANHXE9PGG2 379 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 CCT3P49368 545 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 FUT5Q11128 374 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 CST6Q15828 149 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 DUSP6Q16828 381 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 PGBD2Q6P3X8 592 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 CD300LDQ6UXZ3 194 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 STX19Q8N4C7 294 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 TBC1D19Q8N5T2 526 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 IL17RCQ8NAC3 791 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 RAB8BQ92930 207 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 BCL2L10Q9HD36 194 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 KRBA1A5PL33 1030 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 C5orf58C9J3I9 102 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 TAF4O00268 1085 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 MAN2B1O00754 1011 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 OR1F1O43749 312 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 SERPINB7O75635 380 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 KAT7O95251 611 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 CDH3P22223 829 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG4C-201ENST00000317868 ALDH9A1P49189 494 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms