RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 DUSP2Q05923 314 aa15.96■□□□□ 0.15
PKN3-201ENST00000291906 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PKN3-201ENST00000291906 NEURL3Q96EH8 262 aa15.96■□□□□ 0.15
PKN3-201ENST00000291906 COG8Q96MW5 612 aa15.96■□□□□ 0.15
PKN3-201ENST00000291906 AMDHD1Q96NU7 426 aa15.96■□□□□ 0.15
PKN3-201ENST00000291906 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.96■□□□□ 0.15
PKN3-201ENST00000291906 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PKN3-201ENST00000291906 KLHL33A6NCF5 533 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ALG11Q2TAA5 492 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 TTLQ8NG68 377 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 GPR174Q9BXC1 333 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PADI2Q9Y2J8 665 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 DENND4AQ7Z401 1863 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 A0A0A6YYD5 115 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 HMGN4O00479 90 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 KDM1AO60341 852 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 AKT2P31751 481 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 LTB4RQ15722 352 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 OR2L5Q8NG80 312 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 FAM3CQ92520 227 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 SNX7Q9UNH6 387 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 JRKO75564 520 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 SOX14O95416 240 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ITGA2P17301 1181 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 SAXO2Q658L1 398 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 TAF8Q7Z7C8 310 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 SMRP1Q8NCR6 262 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.95■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 M0R3H8 397 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ITGAMP11215 1152 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 GPR18Q14330 331 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 EOGTQ5NDL2 527 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 XAF1Q6GPH4 301 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 SHISA5Q8N114 240 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 OR9A2Q8NGT5 310 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 EPYCQ99645 322 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PRR14Q9BWN1 585 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 SERHL2Q9H4I8 314 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 TPRKBQ9Y3C4 175 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PCDHGA12O60330 932 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 TEAD1P28347 426 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 SERPINB1P30740 379 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 BNIP3Q12983 259 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ZNF347Q96SE7 839 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PIP5K1AQ99755 562 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 SEMA3GQ9NS98 782 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 STARD5Q9NSY2 213 aa15.94■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 OR10H3O60404 316 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 MT-ND2P03891 347 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 CD247P20963 164 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PTNP21246 168 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 MC3RP41968 323 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 HYAL2Q12891 473 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 RORBQ92753 470 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 NT5DC2Q9H857 520 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 GIMAP4Q9NUV9 329 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ENPP4Q9Y6X5 453 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 SEC16AO15027 2179 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 TRIM64CA6NLI5 447 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 FRS3O43559 492 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 DNAJB6O75190 326 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 F3P13726 295 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 CTSEP14091 401 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 DDX5P17844 614 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 PPP2R1BP30154 601 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 ABATP80404 500 aa15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PKN3-201ENST00000291906 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms