RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BgnP28653 369 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nedd8P29595 81 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pou1f1Q00286 291 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MitfQ08874 526 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpr39Q5U431 456 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbccd1Q640P7 552 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PtprcapQ64697 197 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sox11Q7M6Y2 395 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trmt12Q8BG71 446 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prpf18Q8BM39 342 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Shisa7Q8C3Q5 558 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mfsd6Q8CBH5 775 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxl8Q8CIG9 374 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Grhl2Q8K5C0 625 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr541Q8VGM0 312 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1047Q8VGS0 319 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cby3Q9CVN6 235 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9CZV2 255 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4933421I07RikQ9D420 214 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Erp27Q9D8U3 272 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 H2bfmQ9DAB5 224 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp599E9PWP1 548 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr549E9Q542 316 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc2a2P14246 523 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 EsrrgP62509 458 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BmxP97504 651 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 C1qaP98086 245 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4930438A08RikQ5SPH3 536 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf728Q6P5C7 752 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcdh19Q80TF3 1145 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cpeb2Q812E0 521 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam92aQ8BP22 355 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eri3Q8C460 337 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8K039 155 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BroxQ8K2Q7 411 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Colec12Q8K4Q8 742 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem106aQ8VC04 261 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr441Q8VFS5 310 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Clvs1Q9D4C9 354 aa18.78■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BC034090A0A087WP46 1202 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ect2lA0A140LIP2 953 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mgl2A9XX86 381 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klhl4B1AZR0 717 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam170bE9PXT9 378 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm8267E9Q207 261 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm8926L7MUE8 181 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Clk3O35492 638 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ly6aP05533 134 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gabrg2P22723 474 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 OcmP51879 109 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fitm2P59266 262 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Actr1aP61164 376 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Isl1P61372 349 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hdac2P70288 488 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ugt2b36Q3UEP4 530 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Alg10bQ3UGP8 474 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 E330014E10RikQ3UL33 481 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm906Q3V0M1 1017 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 D5Ertd577eQ499F0 481 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Apex2Q68G58 516 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cypt4Q6P925 153 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf513Q6PD29 541 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpr75Q6X632 540 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cnih3Q6ZWS4 160 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnk12Q76M80 430 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Actr1bQ8R5C5 376 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mto1Q923Z3 669 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MrgprhQ99MT8 321 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam174aQ9D3L0 190 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sars2Q9JJL8 518 aa18.77■□□□□ 0.6
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r90A0A087WR36 309 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm7682A0A0J9YUM1 481 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r56E9Q4U5 779 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hnrnpa2b1O88569 353 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rb1P13405 921 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp59P16373 634 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcbp3P57722 371 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hoxc4Q08624 264 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GiprQ0P543 460 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zdhhc11Q14AK4 347 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp935Q14DI0 353 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ulk3Q3U3Q1 472 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1307Q7TQX1 312 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Avl9Q80U56 649 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tex13c3Q810P0 219 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Peli2Q8BST6 419 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ctdsp2Q8BX07 270 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bpifb2Q8C1E1 462 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atat1Q8K341 421 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r215Q8R264 300 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PglsQ9CQ60 257 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fezf2Q9ESP5 455 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scnn1gQ9WU39 655 aa18.77■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fads2Q9Z0R9 444 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.6 ms