RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTR3BQ9P1U1 418 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ENTPD4Q9Y227 616 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CHST10O43529 356 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMG1O95456 288 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CD59P13987 128 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SHC2P98077 582 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 TLDC1Q6P9B6 456 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T12Q8NG77 320 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SUN3Q8TAQ9 357 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 STMN2Q93045 179 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC74BQ96LY2 380 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRX2Q99811 253 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35A5Q9BS91 424 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF21Q9NSA1 209 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 RXFP3Q9NSD7 469 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 FTSJ1Q9UET6 329 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SERTAD3Q9UJW9 196 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CORO2BQ9UQ03 480 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM220BPB1ANY3 271 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 LMNAP02545 664 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 UQCRC2P22695 453 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGA1P56199 1179 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP2Q05923 314 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SPEM2Q0P670 501 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPB3Q12988 150 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SPIDRQ14159 915 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF750Q32MQ0 723 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 LCN8Q6JVE9 175 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINA11Q86U17 422 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SLITRK4Q8IW52 837 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR135Q8IZ08 494 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP28Q8NHY6 868 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 EPS8L2Q9H6S3 715 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 DCLRE1BQ9H816 532 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 FANCEQ9HB96 536 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CUTCQ9NTM9 273 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GIMAP4Q9NUV9 329 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX13Q9Y5W8 968 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 D6RAR5 112 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YIG0 161 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ARPC2O15144 300 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT36O76013 467 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 C8orf89P0DMQ9 161 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 AVPR1BP47901 424 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK9P50750 372 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 RCBTB1Q8NDN9 531 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM52Q8NDY8 209 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4K14Q8NGD5 310 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC26A7Q8TE54 656 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 EDEM2Q9BV94 578 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PS29 197 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP6O75344 327 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 STAMBPO95630 424 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V1B2P21281 511 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 MPIP34949 423 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SOAT1P35610 550 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 FEN1P39748 380 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 MVDP53602 400 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ACY1Q03154 408 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 RGNQ15493 299 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 AAGABQ6PD74 315 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2R1Q6VVX0 501 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC116Q8IYX3 515 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TNIP2Q8NFZ5 429 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5AK3PQ8NH89 298 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TANKQ92844 425 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CHST8Q9H2A9 424 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 RASSF4Q9H2L5 321 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA4GQ9NTN9 838 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 GPATCH2Q9NW75 528 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSL6Q9UKU0 697 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCA2Q9UQC9 943 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX8Q9Y5X2 465 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNA1HO95180 2353 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOVL7A1L3X0 281 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM227AF5H4B4 570 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF749O43361 778 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 NTRK1P04629 796 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 GGT1P19440 569 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PROSER1Q86XN7 944 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 MICU2Q8IYU8 434 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52N2Q8NGI0 321 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 MVB12AQ96EY5 273 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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